PacBio下机数据解读
今天被人问起如何看懂三代的下机数据，虽然解决了别人的问题，但感觉自己还是没有搞透。 基本的目录结构： 解压后的目录结构： 可以看到数据是以HDF5的格式存储的，格式介绍：PacBio Sequences的HDF5格式 那么，上面目录和文件名都有哪些含义呢？仔细 ...
原文：Pacbio下机数据格式说明
RS IISequel 在下机文件中，主要有三类文件，bam 文件，bam.pbi 文件，以及xml文件。当我们习惯性的去寻找熟悉的fastq格式文件做分析时，发现找不到了，因为在sequel平台中bam 文件成为了它的替代者，因为其更节约储存空间。这是文件格式的一个重大更新。用于后续分析的文件一般是.subreads.bam，这等同于RS II 中的.subreads.fastq 参考资料： h ...
2019-10-18 10:06 0 363 推荐指数：
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