原文:maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总,分析和可视化

本文首发于公众号 生信补给站 ,https: mp.weixin.qq.com s WG JHs RSm IEJiiGEzDkg 之前介绍了使用maftools 从头开始绘制发表级oncoplot 瀑布图 R maftools包绘制组学突变结果 MAF 的oncoplot或者叫 瀑布图 ,以及一些细节的更改和注释。 本文继续介绍maftools对于MAF文件的其他应用,为更易理解和重现,本次使用 ...

2019-09-16 23:19 3 2106 推荐指数:

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【6】肿瘤胚系突变遗传分析数据库使用

目录 遗传性肿瘤简介 检测和分析流程 如何生成一份报告 实例 遗传性肿瘤简介 遗传性肿瘤综合征:由于遗传性原因导致的染色体和基因异常,造成系统性肿瘤患病几率大大增加 germline variant:存在所有细胞中 somatic ...

Fri Aug 28 17:28:00 CST 2020 0 1639
TCGA三个在线可视化网站

1.>c-Bioportal: www.cbioportal.org 整合和简化了包括TCGA,ICGC以及GEO等多个癌症基因组数据库的内容,提供友好可视化的界面,可供下载。 主要展示基因的somatic 突变谱,拷贝数变化,mRNA&miRNA表达量变化,DNA甲基 ...

Tue Oct 17 19:19:00 CST 2017 0 5589
【Matplotlib】数据可视化实例分析

数据可视化实例分析 作者:白宁超 2017年7月19日09:09:07 摘要:数据可视化主要旨在借助于图形手段,清晰有效地传达与沟通信息。但是,这并不就意味着数据可视化就一定因为要实现其功能用途而令人感到枯燥乏味,或者是为了看上去绚丽多彩而显得极端复杂。为了有效地传达思想概念 ...

Wed Jul 19 19:07:00 CST 2017 0 4632
各个平台各种行业的数据可视化分析工具汇总

导读:俗话说“巧妇难为无米之炊”。数据时代,没有一款好的数据可视化分析工具,光有团队怎么行?商场如战场,数据是把枪。亚马逊运用大数据为客户推荐商品信息,阿里用大数据成立了小微金融服务集团,而谷歌更是计划用大数据接管世界……不知不觉,数据已经成为我们生活中必不可少的利器。本文收集了各个平台各种行业 ...

Wed Dec 26 19:12:00 CST 2018 0 1344
Python数据可视化可视化数据分析插件D-Tale

D-Tale数据可视化插件是后端框架Flask与前端框架React组合产生的一款开源的数据可视化分析插件。目前支持DataFrame、Series、MultiIndex、DatetimeIndex 和RangeIndex 等 Pandas的数据结构对象,并且还提供了常规数据结构的函数分析可视化 ...

Thu Nov 25 04:57:00 CST 2021 0 1098
数据可视化(二)

本文来源:https://www.dataquest.io/mission/132/data-visualization-and-exploration 本文数据来源https://github.com/fivethirtyeight/data/blob/master ...

Wed Mar 02 19:23:00 CST 2016 0 8939
 
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