TCGA三个在线可视化网站


1.>c-Bioportal: www.cbioportal.org

整合和简化了包括TCGA,ICGC以及GEO等多个癌症基因组数据库的内容,提供友好可视化的界面,可供下载。

主要展示基因的somatic 突变谱,拷贝数变化,mRNA&miRNA表达量变化,DNA甲基化以及蛋白质表达的情况,并结合患者的临床资料,展示了KM生存曲线。

2.>OncoLnc: www.oncolnc.org

这是一个整合了TCGA的各种RNA数据和患者临床数据,提供生存分析的网站,灰常简单好用。

3.>MEXPRESS:mexpress.be/about

整合了TCGA中的DNA甲基化,表达量及临床数据,主要用来探索甲基化,基因表达和临床表型之间的关联,看界面也很友好


免责声明!

本站转载的文章为个人学习借鉴使用,本站对版权不负任何法律责任。如果侵犯了您的隐私权益,请联系本站邮箱yoyou2525@163.com删除。



 
粤ICP备18138465号  © 2018-2025 CODEPRJ.COM