用Annovar注释非人类基因组，如小鼠mm9
annovar一般只包含人类基因组注释数据库，其他的物种如小鼠需要自己进行建立注释信息。 第一步：下载annovar软件上Annovar官网下载（http://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/），现在要邮件 ...
原文：annovar 注释除人类以外的SNP
. 准备文件： ref.fa ref.gtf或者gff ，最好是gtf ，可将gff 转化为gtf sample.vcf . 用gff ToGenePred与gtfToGenePred工具将gtf或gff 文件转化为reference refGene.txt 软件来自http: hgdownload.soe.ucsc.edu admin exe linux.x gtfToGenePred.dms ...
2019-09-03 12:06 0 358 推荐指数：
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