A survey of best practices for RNA-seq data analysis RNA-seq数据分析指南 内容 前言 各位同学/老师,大家好,现在由我给大家讲讲我的文献阅读报告! A survey of best practices ...
可变剪切的预测已经很流行了,目前主要有两个流派: 用DNA序列以及variant来预测可变剪切 GeneSplicer MaxEntScan dbscSNV S CAP MMSplice clinVar spliceAI 用RNA来预测可变剪切 MISO rMATS DARTS 前言废话 科研圈的热点扎堆现象是永远存在的,且一波接一波,大部分不屑于追热点且不出成果也基本都被圈子给淘汰了。 做纯方法 ...
2019-08-29 21:39 0 460 推荐指数:
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Salmon 概述 该软件采用新的双阶段(dual-phase)统计推断程序,以及针对每个样本存在sequence-specific, fragment GC-content, 和 position ...
与之对应的是single cell RNA-Seq,后面也会有类似文章。 参考:https://github.com/xuzhougeng/Learn-Bioinformatics/ 作业:RNA-seq基础入门传送门 资料:RNA-seq Data Analysis-A Practical ...
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 随着ome为词尾的各种组学的出现,转录组学已经成为了人们了解生物信息的一个重要组成部分。人们使用了许多办法来掌握转录组的情况,主要分为两类,一类是基于杂交,一类是基于下一代测序技术 ...
简单理解RNA-seq 刘小泽 已关注 2018.10.17 23:51* 字数 1518 阅读 46评论 0喜欢 3 今天就当一个小故事看吧,看了statQuest,感觉讲的很棒,于是分享给大家原版视频后台回复 ...
Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutorial 摘要 这篇文章主要阐述了一个典型的单细胞 RNA-seq 分析的详细流程,包括了以下流程: pre-processing -数据预处理 ...
业界良心啊,开源的单细胞课程。 随便看了几章,课程写得非常用心,非常适合新手。 课程地址:Analysis of single cell RNA-seq data 源码地址:hemberg-lab/scRNA.seq.course ...
无生物学重复RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analysis of gene expression data without biological replicates BMC Bioinformatics 的一篇文章中提出了一种新 ...