原文:Deep-learning augmented RNA-seq analysis of transcript splicing | 用深度学习预测可变剪切

可变剪切的预测已经很流行了,目前主要有两个流派: 用DNA序列以及variant来预测可变剪切 GeneSplicer MaxEntScan dbscSNV S CAP MMSplice clinVar spliceAI 用RNA来预测可变剪切 MISO rMATS DARTS 前言废话 科研圈的热点扎堆现象是永远存在的,且一波接一波,大部分不屑于追热点且不出成果也基本都被圈子给淘汰了。 做纯方法 ...

2019-08-29 21:39 0 460 推荐指数:

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Bulk RNA-Seq转录组学习

与之对应的是single cell RNA-Seq,后面也会有类似文章。 参考:https://github.com/xuzhougeng/Learn-Bioinformatics/ 作业:RNA-seq基础入门传送门 资料:RNA-seq Data Analysis-A Practical ...

Thu Aug 03 00:39:00 CST 2017 0 3218
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing)

什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 随着ome为词尾的各种组学的出现,转录组学已经成为了人们了解生物信息的一个重要组成部分。人们使用了许多办法来掌握转录组的情况,主要分为两类,一类是基于杂交,一类是基于下一代测序技术 ...

Fri Oct 19 05:42:00 CST 2018 0 2871
简单理解RNA-seq

简单理解RNA-seq 刘小泽 已关注 2018.10.17 23:51* 字数 1518 阅读 46评论 0喜欢 3 今天就当一个小故事看吧,看了statQuest,感觉讲的很棒,于是分享给大家原版视频后台回复 ...

Sat Oct 20 04:27:00 CST 2018 1 1989
Analysis of single cell RNA-seq data(单细胞终极课程)

业界良心啊,开源的单细胞课程。 随便看了几章,课程写得非常用心,非常适合新手。 课程地址:Analysis of single cell RNA-seq data 源码地址:hemberg-lab/scRNA.seq.course ...

Thu Jul 13 18:56:00 CST 2017 0 1541
 
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