pheatmap实际上是 Pretty Heatmaps 的缩写,简单地来说,一个可以傻瓜式绘制聚类热图的R包。常用参数介绍基础设置main 图的名字file 要保存图的名字color 表示颜色,赋值渐变颜色调色板colorRampPalette属性,选择“绿,黑,红”渐变,分为100个等级,,例 ...
热图可以聚合大量的数据,并可以用一种渐进色来优雅地表现,可以很直观地展现数据的疏密程度或频率高低。 本文利用R语言pheatmap包从头开始绘制各种漂亮的热图。参数像积木,拼凑出你最喜欢的热图即可,如下图: 基因和样本都可以单独聚类,排序,聚类再分组,行列注释,配色调整,调整聚类线以及单元格的宽度和高度均可实现。 载入数据,R包 R包library pheatmap 构建测试数据 set.seed ...
2019-07-30 13:52 0 10680 推荐指数:
pheatmap实际上是 Pretty Heatmaps 的缩写,简单地来说,一个可以傻瓜式绘制聚类热图的R包。常用参数介绍基础设置main 图的名字file 要保存图的名字color 表示颜色,赋值渐变颜色调色板colorRampPalette属性,选择“绿,黑,红”渐变,分为100个等级,,例 ...
曾几何时,三个家伙一起工作,他们分享各种令人振奋的资源链接。然后,其中一个人有一个想法。一个绝妙的主意,是否可以有一种方式来与他人分享这些链接?因此, Muzli 诞生了。所有你需要的设计灵感这里都有,赶紧体验吧。 不错!去看看 您可能感兴趣的相关文章 ...
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和target_layer_name即可,若是多流的,则需要根据自己的实际情况debug,代码不长,比 ...
经常会想到用热图来展示某个基因或某些基因的表达量问题,今天用R中pheatmap包一步步绘制热图。 第一步:公众路径设置,调用包pheatmap,读取目的文件,查看文件。 第二步:逐步深入绘制热图(图1-图15) 一建热图(图1) p<-pheatmap(data ...
主要步骤 pheatmap 数据处理成矩阵形式,给行名列名 用pheatmap画热图(pheatmap函数内部用hclustfun 进行聚类) ggplot2 数据处理成矩阵形式,给行名列名 hclust聚类,改变矩阵行列顺序为聚类后的顺序 melt数据,处理 ...
DEL key [key ...]删除指定的key(一个或多个) DUMP key导出key的值 EXISTS key [key ...]查询一个key是否存在 EXPIRE key ...
、哈希函数、哈希表。 这三者有什么样的爱恨情仇? 为什么Object类中需要有一个hashCode ...