原文:pheatmap绘制“热图”,你需要的都在这

热图可以聚合大量的数据,并可以用一种渐进色来优雅地表现,可以很直观地展现数据的疏密程度或频率高低。 本文利用R语言pheatmap包从头开始绘制各种漂亮的热图。参数像积木,拼凑出你最喜欢的热图即可,如下图: 基因和样本都可以单独聚类,排序,聚类再分组,行列注释,配色调整,调整聚类线以及单元格的宽度和高度均可实现。 载入数据,R包 R包library pheatmap 构建测试数据 set.seed ...

2019-07-30 13:52 0 10680 推荐指数:

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R语言 绘制 pheatmap

pheatmap实际上是 Pretty Heatmaps 的缩写,简单地来说,一个可以傻瓜式绘制聚类的R包。常用参数介绍基础设置main 的名字file 要保存的名字color 表示颜色,赋值渐变颜色调色板colorRampPalette属性,选择“绿,黑,红”渐变,分为100个等级,,例 ...

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