原文:Linux环境下R和R包安装及其管理

前言 R对windows使用很友好,对Linux来说充满了敌意。小数据可以在windows下交互操作,效果很好很棒。可是当我们要处理大数据,或者要在集群上搭建pipeline时,不得不面对在Linux上装R及想要的R包这个难题,尤其是对非root用户而言更是艰难重重。 准备依赖库 依次安装:zlib bzip liblzma pcre curl,注意顺序和版本。目前 . 以上 . 以下R版本相对较 ...

2019-06-06 14:57 0 9730 推荐指数:

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LinuxR环境安装

R环境的两种安装方式,源码编译安装和yum在线安装 第一种:源码编译安装 1.首先,从官网上下载3.5.0版本 2.下载完后记得解压,我的习惯是解压在/usr/local下面 tar -zxvf R-3.5.0.tar.gz 3.然后,安装各种依赖环境 yum install -y ...

Tue May 07 05:54:00 CST 2019 0 7131
RMetaboAnalystR安装指南(Linux环境非root)

前言 这是代谢组学数据分析的一个R,包括用于代谢组学数据分析、可视化和功能注释等众多功能。最近有同事在集群中搭建蛋白和代谢流程,安装这个出现了问题,于是我折腾了一上午。 这个的介绍在:https://github.com/xia-lab/MetaboAnalystR,安装确实还比较复杂 ...

Thu Jul 18 00:01:00 CST 2019 0 775
linuxR安装时退出状态为0

经常由于linux版本较低,R版本较高,安装最新的R时候会出现退出时状态不是0,我安装一个sparklyr,得到错误信息如下: Warning messages:1: In install.packages("sparklyr", dependencies = T ...

Fri Apr 28 04:47:00 CST 2017 0 6642
R(三): R原理及安装

(package)是多个函数的集合,常作为分享代码的基本单元,代码封装成可以方便其他用户使用。越来越多的R正在由世界上不同的人所创建并分发,这些分发的R,可以从CRAN 或 github 上获取,由于向 CRAN 提交审核非常严格,有些开发者并没有将自己开发的R提至CRAN ...

Tue Aug 16 06:51:00 CST 2016 0 2723
linux系统中安装R

1、查看R版本 2、启动R 3, 测试data.table 4、安装data.table 镜像列表:https://cran.r-project.org/mirrors.html 5、测试 ...

Tue Feb 02 08:23:00 CST 2021 0 456
Linux 之改变R安装路径

Linux 之改变R安装路径 背景 linux服务器不同节点安装R默认安装在自己的R路径的library,每个节点都有类似的安装路径,不同节点之间R不能共享。 问题 不同节点如何共用R,省去重复安装R痛苦。 方法 除增加环境变量方法外,如果想长期使用自己设定的路径 ...

Mon Apr 06 01:52:00 CST 2020 0 1267
R安装以及安装

今天看论文,需要用到R语言的库,于是又折腾了半天.. 其实并没有什么太大的问题,只是在第三方的下载方面还有python中使用R方面遇到了问题: 第三方的导入 其实在网上有很多的方法了,R安装 先说结论:最推荐直接使用install.packages ...

Thu Mar 05 03:05:00 CST 2020 0 753
 
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