原文:lammps_data文件

一 notes: 不在data文件里写 注释 ,否则,容易出错 前两行不用写东西 建议 相互作用系数可以不用写在data里边 如pair coeff等 ,可有可无,but for pair coeff,最好还是在data文件中设定,因为它比在in文件中设定更加方便 简洁。 二 主体框架 必须要有 : .数目:原子 键 角 二面角 非二面角的的总数目 .类型:原子 键 角 二面角 非二面角 .box ...

2019-05-04 15:46 0 1669 推荐指数:

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Lammps命令与in文件

LAMMPS 即 Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator (大规模原子分子并行模拟器),是由美国能源部桑迪亚国家实验室开发的一种开源的经典分子动力学模拟代码 in 文件描述一个符合牛顿定律的模拟过程,内容大致包含三个 ...

Tue Jan 08 04:33:00 CST 2019 3 3224
lammps--命令注意

1.create_box  这个关键字看似简单实则让人难受。   ①在写这个关键字的时候切记:一一对应原则,即:     bond/types  对应  extra/bond/per/atom ...

Fri Jul 10 04:09:00 CST 2020 0 579
lammps温度云图

转自:小木虫 田淮安 的回答。 LAMMPS中的温度是由原子的动能计算而来的,具体可参见手册compute temp command一节的说明。LAMMPS的模拟结果,我这里指的是dump命令得到的lammpstrj文件,主要内容都是每个时刻每个原子的信息,包括坐标、速度、动能、势能 ...

Fri Jun 26 00:04:00 CST 2020 4 2215
lammps 计算热导率

原文连接:http://mdbbs.org/thread-19218-1-1.html 看到有不少人在找热导率计算方面的in文件,我就贡献三个in文件吧,仅供参考。同时,附件里贴出了我的计算结果。EMD的输出结果(compute heat/flux command+compute tc ...

Sat Jun 20 04:48:00 CST 2020 8 2396
关于LAMMPS输出【Output】的问题

无论任何模拟,我们都是想从模拟中得到我们想要的数据【data】,然后分析这些数据,从而提取出相关的信息【MAYBE新的发现】,那么数据的输出是必然的一道程序,下面谈谈LAMMPS软件是如何输出dataLAMMPS中处理的输出数据主要分一下三个大的部分:1.断点数据,这个主要是为了防止模拟过程中 ...

Sun Apr 11 05:36:00 CST 2021 0 427
lammps计算的应力的方法

摘自:http://dxli75.blog.163.com/blog/static/106768289201142893419587/ lammps计算的应力有两种: 一是体系整体的应力状态,通过在thermo_style custom里加上pxx pyy pzz pxy pxz pyz字段 ...

Sun May 05 00:37:00 CST 2019 0 2196
LAMMPS常用建模方法总结

内部建模 内部建模,即使用LAMMPS提供的命令建立模型。这种方法主要用于构建比较简单和标准的体系。 相关命令主要有4个: lattice:定义晶格类型; region:定义模拟盒子的大小; create_box:创建模拟盒子; create_atoms:在模拟盒子中创建 ...

Wed Mar 28 22:01:00 CST 2018 0 4096
 
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