原文:学习笔记49—matlab FDR校正

matlab自带函数mafdr,当ttest数较多时,可直接用 FDR, Q mafdr P 但是Storey procedure在p值少于 个时会崩溃,此时应改用BH FDR方法:mafdr P, BHFDR , true 。该方法对于少量ttest更稳健,但是更保守。 参考链接: https: stat.ethz.ch pipermail bioconductor January .html ...

2019-01-08 17:40 0 911 推荐指数:

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matlab FDR校正

http://home.52brain.com/forum.php?mod=viewthread&tid=27066&page=1#pid170857 http://www.math ...

Sat Nov 28 17:46:00 CST 2015 0 4747
学习笔记50—多重假设检验与Bonferroni校正FDR校正

总结起来就三句话: (1)当同一个数据集有n次(n>=2)假设检验时,要做多重假设检验校正 (2)对于Bonferroni校正,是将p-value的cutoff除以n做校正,这样差异基因筛选的p-value cutoff就更小了,从而使得结果更加严谨 (3)FDR校正是对每个 ...

Wed Jan 09 01:49:00 CST 2019 0 689
FDR校正

一、假设检验 假设检验的基本思路是: 设立零假设(null hypothesis)H0,以及与零假设H0相对应的非零假设(alternative hypothesis)H1,在假设H0成立的前提下 ...

Mon Aug 03 05:06:00 CST 2020 0 699
SPM FDR校正

来源: http://blog.sciencenet.cn/blog-479412-572049.html,http://52brain.com/thread-15512-1-1.html SPM8允许两种FDR校验。一个是voxel-wise FDR,另一个是topological ...

Wed Oct 28 23:41:00 CST 2015 0 3154
浅谈多重检验校正FDR

浅谈多重检验校正FDR Posted: 四月 12, 2017 Under: Basic By Kai no Comments 例如,在我们对鉴定到的差异蛋白做GO功能注释后,通常会计算一个p值。当某个蛋白的p值小于0.05(5%)时,我们通常认为这个蛋白在两个样本中的表达 ...

Sat Nov 10 05:37:00 CST 2018 0 2238
matlab学习笔记(4)

第9章 数学建模函数 曲线拟合: 多项式拟合: polyfit()函数:采用最小二乘法进行多项式拟合。   polyfit(x,y,n); %对于数据集[x,y],找到次数为n的多项 ...

Tue Feb 28 19:42:00 CST 2017 0 1500
Matlab学习笔记(五)

三、矩阵运算 (一)矩阵函数和特殊矩阵 常见的矩阵处理函数 表3-1 常见的矩阵函数 函数 说明 ...

Thu Mar 07 06:46:00 CST 2019 1 565
MATLAB学习笔记(二)——主要是MATLAB的矩阵知识

PS:主要是讲解矩阵的相应的实现方法,其实MATLAB的很大一部分的优势,就是集成了矩阵级别的运算,并以此为特点,可以进行多维空间上的验证。 让我们懂得了原来线性代数如此有用= - =。 (一)MATLAB矩阵 一、矩阵的建立 1、直接输入法创建: 还可 ...

Tue Jan 13 09:20:00 CST 2015 0 20854
 
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