tophat cufflinks cuffcompare cuffmerge 的使用
Cole Trapnell said： there are three strategies:1) merge bams and assemble in a single run of Cufflinks2) assemble each bam and cuffcompare them ...
原文：使用Tophat+cufflinks分析差异表达
使用Tophat cufflinks分析差异表达 : : 使用TopHat Cufflinks的流程图 序列的比对是RNA分析流程中核心的一步。序列的比对，或者说是字符串的比对本身就是计算机科学中的一个经典问题，在生物信息学中更加频繁的出现。序列比对中的错配，插入 缺失可以识别出样本和基因组之间的多态性，甚至可以找出肿瘤样本中的gene fusion。而map到没有注释的基因可能是新的编码基因， ...
2018-11-09 22:17 0 2756 推荐指数：
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