转录组分析---Hisat2+StringTie+Ballgown使用 (2016-10-10 08:14:45) 转载▼ 标签: 生物信息学 转录组 1.Hisat2建立 ...
HISAT StringTie Ballgown安装及使用流程 年Nature Methods上面发表了一款快速比对工具hisat,作为接替tophat和bowtie的比对工具,它具有更快的比对速度和更高的比对率,最近把这个流程走完一遍,感觉优势还是很明显的。一 HISAT : 下载安装:hisat 下载地址:ftp: ftp.ccb.jhu.edu pub infphilo hisat down ...
2018-11-09 21:51 0 3946 推荐指数:
转录组分析---Hisat2+StringTie+Ballgown使用 (2016-10-10 08:14:45) 转载▼ 标签: 生物信息学 转录组 1.Hisat2建立 ...
HISAT2,StringTie,Ballgown处理转录组数据 本文总阅读量次2017-05-26 HISAT2,StringTie,Ballgown处理转录组数据思路如下: 数据质控 将RNA-seq的测序reads使用hisat2比对 samtools ...
转载于:https://www.ivistang.com/articles/312 准备软件和数据 安装miniconda wget -c https://repo.anaconda.com/miniconda ...
HISAT2官网https://daehwankimlab.github.io/hisat2/ HISAT2 下载 https://daehwankimlab.github.io/hisat2/download/ Binaries Version: HISAT2 2.2.1 ...
StringTie 参考链接:https://ccb.jhu.edu/software/stringtie/index.shtml?t=manual#input 参数简介 StringTie的基本用法: stringtie <aligned_reads.bam> [options ...
1. 安装nodejs 去 https://nodejs.org/en/下载安装文件安装即可。 安装完成后,在终端输入node -v回车打印出nodejs的版本号,说明nodejs安装成功。 在终端输入npm -v回车打印出npm的版本号,说明npm也安装成功(node ...
转录本组装软件StringTie的使用说明 StringTie 转录本组装软件StringTie的使用说明 转录组分析流程 HISTA + StringTie 组合。其Protocol 发表在Nature Protocol ...