原文:plink命令

用plink远程登陆link主机执行脚本,但是无法执行sudo命令完成后自己关闭 plink l root . . . df h plink.exe ssh pw aaaaaausername . . . home username test.sh 使用Putty提供的pscp.exe命令实现Linux文件上传与下载: pscp localfile rootuser remoteip: fileD ...

2018-08-27 12:19 0 2290 推荐指数:

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plink 使用方法

  全基因组关联分析是利用统计方法研究与性状相关联的基因。常用的软件有plink,tassel,falmm等, 其中尽管R语言中提供了几种常见的文件格式,个人感觉plink文件格式已经成为了广泛使用的基本格式。下面 是我在学习期间的plink学习总结,请笑纳 ...

Tue May 10 08:52:00 CST 2016 0 8404
plink 进行PCA分析

当我们进行群体遗传分析时,得到vcf后,可利用plink进行主成分(PCA)分析; 一、软件安装 二、使用流程 第一步:将vcf转换为plink格式 上述会得到.map, .nosex和.ped结尾的三个文件。 第二步 ...

Sun Apr 26 22:00:00 CST 2020 0 3506
plink参数说明

Plink: command-line connection utilityRelease 0.67Usage: plink [options] [user@]host [command] ("host" can also be a PuTTY saved session name ...

Fri Nov 18 16:19:00 CST 2016 0 4497
plink 与 ssh 远程登录问题

plink 是一种 putty-tools,ubuntu 环境下,如果没有安装 plink,可通过如下方法进行安装: $ echo y | sudo apt-get install plink 1. 解决ssh第一次登录需要交互确认的问题 解决SSH第一次登录需要交互确认的问题 echo ...

Sun Sep 17 02:36:00 CST 2017 0 2019
利用plink软件基于LD信息过滤SNP

最近有需求,对WGS测序获得SNP信息进行筛减,可问题是测序个体少,call rate,maf,hwe,等条件过滤后,snp数量还是千万级别,所以后面利用plink工具根据LD信息来滤除大量SNP标记。 工具版本:PLINK v1.90b4.6 64-bit (15 Aug 2017) 一、格式 ...

Thu Dec 12 05:21:00 CST 2019 0 1172
plink 阈性状(质量性状)GWAS分析

plink进行阈性状(质量性状)关联分析有两种方法 --assoc 和 --logistic, 这两种方法又分别有分是否校正: --assoc --adjust 和 --logistic --adjust --logistic方法有可以选择是否添加协变量: --logistic ...

Sat Dec 18 07:47:00 CST 2021 0 1692
plink Error: File read failure.

1、问题,莫名其妙出现下面的问题,折腾半天也没有找出原因,后来索性暴力解决,直接解压文件看看咋回事, 解压半天提示文件损坏,。。。。 Error: File read failure. 2、重新下载文件,测试 这次没有报错。 当plink 处理 ...

Tue Dec 14 18:25:00 CST 2021 13 635
 
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