Bedtools genomecov 计算覆盖度
简单说明： 从2.28.0版开始，bedtools使用htslib库支持CRAM格式 除了BAM文件，bedtools默认所有的输入文件都以TAB键分割 除非使用-sorted选项，b ...
原文：如何计算每个基因的覆盖度与深度
如何计算每个基因的覆盖度与深度，有多种方法可以完成。如下演示使用samtools depth命令方法 . 数据下载 . Fastq文件下载 从NCBI下载Illumina Hiseq X Ten平台的RNA Seq数据SRR 信息如上图所示。 . . 使用wget命令 sra toolkit工具下载太慢 下载 wget ftp: ftp.ncbi.nlm.nih.gov sra sra inst ...
2018-08-26 09:57 0 3027 推荐指数：
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