背景：16SrRNA 基因通常作为分子标记进行微生物群落结构的研究，但是它有一些明显的限制，比如16S rRNA基因在物种中会有多个拷贝，而且，由于16S rRNA基因的进化速率较慢，在物种间保守，会存在多个物种的基因完全相同的情况，而且由于基因水平转移的发生，即使亲缘关系较远的物种，也可能出现 ...

在数据分析中，经常需要下载物种的参考基因组序列，这时有很多数据库可以选择，比如NCBI, Ensembl, UCSC这三个通用的数据库，或者该物种特有的数据库， 比如模式生物拟南芥等有专门的数据库。 在NCBI, Ensembl 和 UCSC中对于同一个物种，编号不统一，在这里整理一下它们之间 ...

植物基因组数据库：1、NCBI中的genome，直接下载NCBI上的基因组文件 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/ 2、植物基因组数据库（包含约30个左右的植物，具体查看:） 30个左右植物基因组对应列表 下载 http ...

目录 一:数据库演变史 1.什么是数据库? 2.数据库的作用 二:数据库的演变方向 1.文件操作阶段(保存数据(读写方式)) 2.软件开发目录 ...

RNA-seq 测序可以用于融合基因的发现，在过去的十几年里，RNA-seq 测序数据不断增加，发现的融合基因的数据也不断增加； FusionCancer 是一个人类癌症相关的融合基因的数据库，利用NCBI SRA数据库中的RNA-seq 数据，采用tophat-fusion ...

HGNC 全称为HUGO Gene Nomenclature Committee, 叫做 HUGO基因命名委员会，负责对人类基因组上包括蛋白编码基因， ｎｃＲＮＡ基因，甲基因和其他基因在内的所有基因提供一个唯一的，标准的，可以广泛传播的symbol; 数据库的主页为　http ...

1.Redis数据库介绍 Redis是一个开源的使用ANSI C语言编写、支持网络、可基于内存亦可持久化的日志型、Key-Value数据库，并提供多种语言的API。 2.Redis数据库特性 Redis支持数据的持久化，可以将内存中的数据保存在磁盘中，重启的时候可以再次加载进行 ...

1 Redis简介 Redis，全称远程字典服务（REmote DIctionary Server），是一个开源、基于内存、高性能、可数据持久化的key-value存储系统，遵守BSD协议，可用作数据库、缓存和消息中间件。 在Redis中文官网上是这么描述的： redis是一个开源 ...