1、安装samtools 软件中 遇到如下错误： 2、解决办法： 参考：https://support.huaweicloud.com/topic/199412-5-Q ...

1、安装samtoos软件过程中遇到如下报错： 2、解决方法，参考：http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=3249515&do=blog&id=1012337 ...

1、安装samtools软件过程中遇到如下错误： 2、解决办法： 参考：https://github.com/samtools/htslib/issues/702 ...

主要介绍一下 SAMtools 的用法。它被誉为 NGS 里面的 瑞士军刀，功能很是强大，所以值得好好学习一番。 文档参考 总站 samtools-mannual github-samtools 标准流程 推荐： blog SAMtools: Primer ...

有很多种格式来记录mapping的结果，大多数都收录在UCSC的帮助文档中。在mapping之后，如何对mapping的结果进行评估呢？ 最简单的，就是通过samtools来评估mapping质量了。 samtools idxstats aln.sorted.bam 注意，这一步之前需要 ...

方便人们的使用。 软件是功能，功能的实现是靠软件。 计算机造出来了，但是普通人是无法使用的。因为没有软件，无法操作。 后来安装了操作系统，可以操作了，但是很繁琐，得专业人士才能记住那些命令。 再后来为普通用户开发了软件，带有界面，人们可以直观的操作，计算机才推广 ...

对于双端比对的数据，生成的BAM文件中，R1端序列和R2端序列的标识符是一样的，之前一直不知道如何根据bam文件区分哪条序列是R1端，哪条序列是R2端，昨天仔细研究了一下，原来代表R1端和R2端的信息 ...

源自：http://sanwen.net/a/hirxmpo.html samtools是一系列处理bam和sam格式文件的应用程序集合，具有众多的功能。 首先呢，bam和sam文件主要是bwa、bowtie、tophat等序列比对工具产生的，这些软件我们后面会谈到。 软件下载安装： 地址 ...