用--recode命令，--out表示转化的文件的名字，本例已经命名为“filter” ...

1、PED简介 PED文件格式是广泛使用的用于连锁系谱数据分析的格式，并用作plink程序的输入。PLINK是一个免费的，开源的全基因组关联分析工集，旨在以高计算效率的方式执行一系列基本的，大规模的分析。PED能够处理二倍体SNP数据。 空格(空格或制表符)分隔的文本文件*.ped ...

BED 文件格式 BED 文件格式是一个可变方式的数据线，用来描述注释的数据。BED线有3个要求的字段和9个额外的字段。每条线的字段数目必须是任意单条数据的在注释上一致。可选字段的序试结合低数字的字段必须流行如果高位字段被使用。 首先是三个要求的BED字段 chrom ...

bed文件（browse extensive data）以及gff文件（general fearture format） bed文件 第一列是染色体或者contig信息。 第二列是起始位置，从0开始。 第三列是终止位置。 第四列是bed列的名字。 第五列是score。 第六列是链方向 ...

1）BED文件 BED 文件(Browser Extensible Data)格式是ucsc 的genome browser的一个格式 ,提供了一种灵活的方式来定义的数据行，以用来描述注释信息。BED行有3个必须的列和9个额外可选的列。每行的数据格式要求一致(见下图)。 每条线的字段 ...

（1） <?php function objtoarr($obj){$ret = array();foreach($obj as $key =>$value){if(gettype($v ...

一：脚本功能： 批量处理目录以及子目录下的文件格式问题，能够轻易的将linux格式转换为dos格式。 二：写此博客的意义： 1、只是为了熟悉shell脚本,仅此而已 三：下面介绍两种方法使用脚本： 1、本教程附带给你脚本，按照教程使用即可，不用过多的了解内部代码结构。 2、解释 ...

1.利用Linux命令：awk 2.用法如下： awk '{if(NR%4 == 1){print ">" substr($0, 2)}}{if(NR%4 == 2){print}}' fastq > fasta 3.上述用法注意事项： fastq文件必须是解压格式 ...