原文:用R的dgCMatrix包来构建稀疏矩阵 | sparse matrix by dgCMatrix

sparse matrix是用来存储大型稀疏矩阵用得,单细胞表达数据基本都用这个格式来存储,因为单细胞很大部分都是 ,用普通文本矩阵存储太占空间。 使用也是相当简单: library Matrix readsCount lt read.csv data count.csv , header T, row.names readsCountSM lt as as.matrix readsCount ...

2018-03-28 17:16 0 3450 推荐指数:

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scipy.sparse 稀疏矩阵

from 博客园(华夏35度)http://www.cnblogs.com/zhangchaoyang 作者:Orisun 本文主要围绕scipy中的稀疏矩阵展开,也会介绍几种scipy之外的稀疏矩阵的存储方式。 dok_matrix 继承自dict,key是(row,col ...

Thu Nov 02 21:54:00 CST 2017 0 2459
R语言矩阵matrix函数

矩阵是元素布置成二维矩形布局的R对象。 它们包含相同原子类型的元素。尽管我们可以创建只包含字符或只逻辑值的矩阵,但是它们没有多大用处。我们使用的是在数学计算中含有数字元素矩阵。 使用 matrix()函数创建一个矩阵。 语法 R语言中创建矩阵的基本语法是: matrix(data ...

Sun Aug 06 03:59:00 CST 2017 0 19767
Python 高维数组“稀疏矩阵”scipy sparse学习笔记

scipy 里面的sparse函数进行的矩阵存储 可以节省内存 主要是scipy里面的 sparse 这里目前只用到两个 稀疏矩阵的读取 转稀疏矩阵为普通矩阵 处理成为普通矩阵之后可以调用pd.DataFrame()转化为数据框之后的操作就比较好 ...

Sun Jan 19 07:49:00 CST 2020 2 1112
 
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