原文:Annovar 信息注释

ANNOVAR 注释软件 ANNOVAR简介 ANNOVAR结构 ANNOVAR下载数据库 ANNOVAR输入格式 ANNOVAR格式转换 ANNOVAR注释功能 用table annovar.pl进行注释 可一次性完成三种类型的注释 Gene based Annotation 基于基因的注释 ex .variant function ex .exonic variant function Re ...

2017-12-29 16:13 0 2638 推荐指数:

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annovar 注释除人类以外的SNP

1. 准备文件: ref.fa ref.gtf或者gff3,最好是gtf3,可将gff3转化为gtf sample.vcf 2. 用gff3ToGenePred与gtfToGen ...

Tue Sep 03 20:06:00 CST 2019 0 358
制作annovar注释依赖的cosmic数据库

1. 文件准备 COSMIC相关文件下载 COSMIC更新了下载规则。以前直接用ftp可以下载,现在麻烦一些,要根据它们提供的指导规则下载。 以GRCh37/cosmic/v90/VCF/Cosm ...

Fri Sep 20 18:13:00 CST 2019 0 401
Annovar注释非人类基因组,如小鼠mm9

annovar一般只包含人类基因组注释数据库,其他的物种如小鼠需要自己进行建立注释信息。 第一步:下载annovar软件上Annovar官网下载(http://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/),现在要邮件 ...

Tue Jul 04 05:19:00 CST 2017 0 1576
ANNOVAR工具

,则程序还生成新的VCF输出文件,其中INFO字段填充有注释信息。 假设我们已经下载了ANNOVAR包 ...

Thu Jul 19 05:07:00 CST 2018 0 1199
git修改push的注释信息

修改还未push的注释: git commit --amend 修改后保存退出。 刚刚push到远端还没有人其他人下载或改动的: git commit --amend进入修改页面修改注释信息,修改后:wq保存退出。 再使用git push --force-with-lease origin ...

Mon Mar 11 17:57:00 CST 2019 0 1400
 
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