1.>c-Bioportal: www.cbioportal.org 整合和简化了包括TCGA,ICGC以及GEO等多个癌症基因组数据库的内容,提供友好可视化的界面,可供下载。 主要展示基因的somatic 突变谱,拷贝数变化,mRNA&miRNA表达量变化,DNA甲基化 ...
中国大牛力作 张泽民: http: gepia.cancer pku.cn index.html http: cancer pku.cn ...
2017-12-22 11:26 0 1973 推荐指数:
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最出名,http://www.cbioportal.org/ 特色:最基本的简单分析基因突变、共表达/共突变的基因,下载数据也可以,最常看的应该还是oncoPrint那个。 详细用法:TCGA数据库的数据怎么查? 最方便,Ge-mini 特色:手机app,可随时查看,主要关注基因表达 ...
本文首发于公众号“生信补给站”,https://mp.weixin.qq.com/s/WG4JHs9RSm5IEJiiGEzDkg 之前介绍了使用maftools | 从头开始 ...
TCGA数据库 是 生物信息分析经常需要用到的数据库,今天学习了一下怎么在其官网上下载数据集 以下以下载肾上腺皮质癌患者的miRNA表达数据为例,来讲解具体的过程 第一步,打开TCGA网址:https://portal.gdc.cancer.gov 第二步,点击导航栏最右 ...
http://mirgator.kobic.re.kr/help.html ...
http://mexpress.be/ ...
https://github.com/Jialab-UCR/GDCRNATools GDCRNATools - An R package for downloading, organizing ...
上周收到一条求助信息:“如何用TCGA数据库分析LINC00152在卵巢癌与正常组织的的表达差异?” 所以以这个题目为记录分析过程如下: 一、下载数据 a)进入网站https://cancergenome.nih.gov/ 网页截图如下: b)进入数据下载 Launch ...