原文:ROSETTA使用技巧随笔--蛋白蛋白对接

先写简略版,以后再详细写。 . 对输入结构进行预处理 refine gt relax.default.linuxgccrelease in:file:s input files from rcsb qys.pdb flag input relax flag input relax: . local dock 执行局部对接之前应手动把受体和配体放到一个pdb文件中,用不同的链标注 例如A,B ,相距 ...

2017-11-10 16:18 2 2544 推荐指数:

查看详情

ROSETTA使用技巧随笔--RosettaLigand Docking

时间不充分,简单记录下自己实践过程中的做法: 1. 首先,非标准残基都需要转换成.params文件,使用 <path-to-Rosetta>/main/source/scripts/python/public/molfile_to_params.py -n TPP TPP.mol2 ...

Wed Jan 24 00:28:00 CST 2018 7 1282
【3】蛋白鉴定软件之Mascot

目录 1.简介 2.配置 2.1在线版本 2.2 服务器版本 3.运行 3.1 在线版本 3.2 服务器版本 4.结果 1.简介 Mascot是非常经典的蛋白鉴定软件,被Frost ...

Sat Aug 29 00:39:00 CST 2020 0 1752
【2】蛋白鉴定软件之Comet

目录 1.简介 2.下载安装 3.软件使用 4.结果 1.简介 官网:http://comet-ms.sourceforge.net/ 1993年开发,持续更新,免费开源 适用Windows/Linux 多线程,支持多种输入输出 ...

Fri Aug 28 23:10:00 CST 2020 0 813
蛋白组DIA分析:Spectronaut软件使用指南

官方文档: https://biognosys.com/media.ashx/spectronautmanual.pdf 0. 准备 Spectronaut软件是蛋白组DIA分析最常用的谱图解析软件之一,优点是定量准确,缺点是高额收费,window版本,速度慢。一起来简单了解下用法 ...

Fri Mar 13 00:11:00 CST 2020 0 2064
【1】蛋白鉴定软件之X!Tandem

目录 1. 简介 2.下载安装 3. 软件试用 4. 结果 5. FAQ 1. 简介 X!Tandem是GPM:The Global Proteome Machine(主要基于Web的开源用户界面,用于分析和显示蛋白质鉴定数据。关于GPM的更多 ...

Fri Aug 28 17:38:00 CST 2020 0 1319
蛋白减肥法

方案: 🌟早:乳清蛋白粉30g+膳食纤维10g+温水300ml+多种维生素1粒+鱼油1粒 🌟加餐:500-800ml水 🌟中:主食25g+蛋白质类食物100g+蔬菜250g 🌟加餐:乳清蛋白粉30g+膳食纤维10g+温水300ml 🌟晚:主食25g+蛋白质类食物100g+蔬菜 ...

Fri Feb 11 21:19:00 CST 2022 2 693
 
粤ICP备18138465号  © 2018-2025 CODEPRJ.COM