主要步骤 pheatmap 数据处理成矩阵形式,给行名列名 用pheatmap画热图(pheatmap函数内部用hclustfun 进行聚类) ggplot2 数据处理成矩阵形式,给行名列名 hclust聚类,改变矩阵行列顺序为聚类后的顺序 melt数据,处理 ...
聚类:计算distance:dist data ,data必须是数字类型的,如果有字符串类型的必须去掉。否则会出现错误。 热图: 两种方法:一是ggplot 自带的geom tile 二是pheatmap包。 一,使用geom tile ,需要自己聚类数据。 二,使用pheatmap包,设置参数即可聚类数据。 ...
2018-07-03 16:38 0 808 推荐指数:
主要步骤 pheatmap 数据处理成矩阵形式,给行名列名 用pheatmap画热图(pheatmap函数内部用hclustfun 进行聚类) ggplot2 数据处理成矩阵形式,给行名列名 hclust聚类,改变矩阵行列顺序为聚类后的顺序 melt数据,处理 ...
1、前言 聚类分析是机器学习和数据分析中非常常见的分类方法, 当我们用到层次聚类(系统聚类)时,最常用的分析方法就是绘制树状图, 比较常见的统计软件像SPSS、SAS、R等都可以直接绘制树状图,比较简单, 2、Plotly python绘制树状图主要介绍使用Plotly工具 2.1 ...
origin 画热图 觉得有用的话,欢迎一起讨论相互学习~ 步骤 假如要画3个变量随着时间迭代的热力图。 将变量名称填入long-name,将迭代此处写在第一列-即origin中的x列,如下图所示: 选中整张表格,Plot->Heat Map-> ...
代码展示 Note:我是将自己的网络训练后保存模型,再加载未预训练的Resnet50模型,再加载自己主干网络的参数最后输出提取的特征,这样不用改动太多代码 比较便捷的一点就 ...
HeatMap(热图)的原理和实现 先来看两张图: (1)10年世界杯决赛,冠军西班牙队中门将、后卫、中场及前锋的跑位热图 通过热图,我们可以很清楚的看出四个球员在比赛中跑动位置的差异。 (2)历史地震震源位置的热图 也可以很清楚的看出,哪个地方是地震的高发地区(频率最高 ...
先来看两张图: (1)10年世界杯决赛,冠军西班牙队中门将、后卫、中场及前锋的跑位热图 通过热图,我们可以很清楚的看出四个球员在比赛中跑动位置的差异。 (2)历史地震震源位置的热图 也可以很清楚的看出,哪个地方是地震的高发地区(频率最高)。 HeatMap简介 上面两张就是热图 ...
MATLAB实例:聚类网络连接图 作者:凯鲁嘎吉 - 博客园 http://www.cnblogs.com/kailugaji/ 本文给出一个简单实例,先生成2维高斯数据,得到数据之后,用模糊C均值(FCM)算法对数据进行聚类,得到聚类中心,然后绘制每一类数据到聚类中心的网络连接图 ...
1、脚本 2、聚类过程的示意树状图 3、按语 此树状图的底部显示的是数据点,这些数据点作为叶节点最终形成一棵聚类树,每合并两个两个簇就生成一个父节点。 ...