人类基因组在三大基因数据库中的不同版本
在数据分析中，经常需要下载物种的参考基因组序列，这时有很多数据库可以选择，比如NCBI, Ensembl, UCSC这三个通用的数据库，或者该物种特有的数据库， 比如模式生物拟南芥等有专门的数据库。 在NCBI, Ensembl 和 UCSC中对于同一个物种，编号不统一，在这里整理一下它们之间 ...
原文：FusionCancer-人类癌症相关的融合基因的数据库
RNA seq 测序可以用于融合基因的发现，在过去的十几年里，RNA seq 测序数据不断增加，发现的融合基因的数据也不断增加 FusionCancer 是一个人类癌症相关的融合基因的数据库，利用NCBI SRA数据库中的RNA seq 数据，采用tophat fusion, soap fusion, fusionmap, chimerascan 款预测融合基因的软件进行预测 网址如下： http ...
2017-09-26 15:01 2 2635 推荐指数：
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植物基因组数据库：1、NCBI中的genome，直接下载NCBI上的基因组文件 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/ 2、植物基因组数据库（包含约30个左右的植物，具体查看:） 30个左右植物基因组对应列表 下载 http ...
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