微生物群落多样性测序与功能分析 1.几个概念:16S rDNA(或16S rRNA);OTU;测序区段。 1.3测序区段:由于16S rDNA较长(1.5kb),我们只能对其中经常变化的区域也就是可变区进行测序。16S rDNA包含有9个可变区,分别是v1-v9。一般我们对v3-v4双可变区域 ...
在微生物测序中,样本的准备从根本上是确保获得高质量DNA的前提,而样本准备也正是让众多微生物科研工作者感到困扰的重要一步。今天就给大家分类介绍一下常见的微生物样本类型及采样方法 微生物测序样本准备方法 医口样本类型 样本 种类 推荐生物学重复 肠道 粪便,粘膜 , 推荐 液体 尿,血液,脑髓液,唾液,痰,肺泡灌洗液,羊水 同上 拭子 口腔,生殖道,皮肤 同上 其它 组织,肝脏,眼部,胎盘等 同上 ...
2017-08-03 00:14 0 2212 推荐指数:
微生物群落多样性测序与功能分析 1.几个概念:16S rDNA(或16S rRNA);OTU;测序区段。 1.3测序区段:由于16S rDNA较长(1.5kb),我们只能对其中经常变化的区域也就是可变区进行测序。16S rDNA包含有9个可变区,分别是v1-v9。一般我们对v3-v4双可变区域 ...
TOP ## 1 简介 虽然做生长曲线和求代际时间貌似是个很简单常规的东西,可是到我一直不大确定自己求的对不对... 这次下定决心不再乱做... 不看解释,跳到[作图](#tag) ## 2 定义 ### 微生物 * 细菌,真菌 培养和测定 细菌:液体培养,不同的时间测定OD600 ...
细菌-葡萄球菌 葡萄球菌葡萄球菌是一群革兰氏阳性球菌,因常堆聚成葡萄串状,故名。多数为非致病菌,少数可导致疾病。葡萄球菌是最常见的化脓性球菌,是医院交叉感染的重要来源,菌体直径约0.8μm,小球形, ...
注:此PPT来自上海交通大学附属第六人民医院陈璐老师的讲座,侵权删。\ ...
)在自然界中分布较广,是一种常见的病原微生物,呈球形或椭圆形,直径0.6-1.0μm,呈链状排列,长短 ...
细菌-肺炎链球菌(乳杆菌目细菌) 肺炎链球菌于1881年首次由巴斯德(Louis Pasteur)及G. M. Sternberg分别在法国及美国从患者痰液中分离出。为革兰染色阳性,菌体似矛头状,成 ...
2017年4月28日,核酸研究(Nucleic Acids Research)杂志上,在线公布了一个可搜索微生物次生代谢物合成基因组簇的综合性数据库antiSMASH数据库 4.0版,前3版年均引用250次,累计引物1600+;可实现基因组与基因组之间的相关天然产物合成基因簇的查询和预测 ...
目录 1.混合测序基础 2. 点突变检测 3. BSA 4. BSR 5. 混合样本GWAS分析 6. 混合样本驯化研究 7. 小结 1.混合测序基础 测序成本虽然下降了,但对于植物育种应用研究来说还是很高,动不动就上百群体,小小植物个体 ...