人类基因组概况: 人类基因组由ATCG四种碱基组成,但是CG的含量低于50%,所以CG含量低于AT含量。 一个基因组的dna大约3ug。 snp: 平均每100到1000个碱基会出现1个SNPs,不过密度并不 ...
线粒体基因组是一个环状的双链DNA分子,包括轻链 L 和 重链 H, 其基因结构在哺乳动物中保守, 以human 线粒体为例, 人类线粒体基因组全长 , bp , 共有 个编码蛋白的基因,根据编码的蛋白可以分成 类: 共有 种tRNA的基因 种 rRNA 基因: 在人类的线粒体基因组中,轻链共有 个基因,其中 个基因都是编码tRNA 重链共有 个基因 除了基因区域外,在线粒体基因组中,还有一个调控 ...
2017-06-27 17:39 0 8083 推荐指数:
人类基因组概况: 人类基因组由ATCG四种碱基组成,但是CG的含量低于50%,所以CG含量低于AT含量。 一个基因组的dna大约3ug。 snp: 平均每100到1000个碱基会出现1个SNPs,不过密度并不 ...
的关系,以人类基因组为例: 在NCBI中,对于不同的拼装版本,以NCBI Build Number ...
基因组注释主要包括四个研究方向:重复序列的识别;非编码RNA的预测;基因结构预测和基因功能注释。我们将分别对这四个领域进行阐述。 1 重复序列的识别。 1.1 重复序列的研究背景和意义:重复序列可分为串联重复序列(Tendam repeat)和散在重复序列 ...
参考基因组版本命名参考基因组联盟(Genome Reference Consortium),它是由 NCBI,EBI,桑格研究所等机构组成。GRC 利用最佳的技术装配,纠正,增加基因组序列,以此作为在生信分析领域作为参考的基因组。人基因组官名叫 GRCh38 (Genome ...
全基因组选择(Genomic selection, GS)是一种利用覆盖全基因组的高密度标记进行选择育种的新方法,可通过早期选择缩短世代间隔,提高育种值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)估计准确性等加快遗传进展,尤其对低遗传力、难测定的复杂性状具有较好 ...
annovar一般只包含人类基因组注释数据库,其他的物种如小鼠需要自己进行建立注释信息。 第一步:下载annovar软件上Annovar官网下载(http://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/),现在要邮件 ...
HGNC 全称为HUGO Gene Nomenclature Committee, 叫做 HUGO基因命名委员会,负责对人类基因组上包括蛋白编码基因, ncRNA基因,甲基因和其他基因在内的所有基因提供一个唯一的,标准的,可以广泛传播的symbol; 数据库的主页为 http ...
考虑到cnblog不适合基因组领域这种类型的文章, 最终,我自己开通了公众号:碱基矿工,欢迎感兴趣的同学关注! 也可以关注我的知乎:https://www.zhihu.com/people/yellowtree/activities 2018年1月修改:这篇文章写于2013年,首发 ...