gene-based关联分析研究是SNP-based关联分析研究的一个补充。 目前有很多工具支持gene-based关联分析研究，比如GCTA，VEGAS2等。 下面主要介绍一下怎么用VEGAS2做gene-based的关联分析研究。 先说VEGAS2的优点，输入特别简单，不需要准备太多 ...

本文为入门级的基因调控网络文章，主要介绍一些基本概念及常见的GRN模型。 概念：基因调控网络 (Gene Regulatory Network, GRN)，简称调控网络，指细胞内或一个基因组内基因和基因之间的相互作用关系形成的网络，特指基因调控 (gene regulation) 导致基因 ...

Study）进行gene based的关联分析研究。 但用过的人就知道，VEGAS2有个很明显的缺点 ...

之前已经写过两篇gene-based 关联分析研究，感兴趣翻往期推文： 基于GCTA的gene-based关联分析研究 使用VEGAS2（Versatile Gene-based Association Study）进行gene based的研究 今日再介绍第三款软件：MAGMA 跟前 ...

ceRNA 不同于mRNA, lncRNA, ncRNA 等概念，其指的既不是某一种类型的RNA(比如mRNA, lncRNA), 也不是某一类的RNA(如ncRNA); ceRNA 其实指的是不同种类的RNA之间的调控机制，英文名为 competing endogenous RNA , 翻译成 ...

gene symbol： TP53 gene ID：7157。Entrez Gene ID，它是目前国际上最权威的Gene ID编号！ GENECODE：GENECODE来自Ensembl数据库。没有ID。它有gtf文件。 HGNC（人类基因命名委员会）只对人类基因进行命名 ...

1 引言 网络报文抓取是指通过对主机网络设备的探测，实现获取该网络当前传输的所有信息，并根据信息的源主机、目标主机、服务协议和端口等信息简单过滤掉不关心数据，然后提交给上层应用程序进行进一步处理。 2 网络数据包捕获原理 一个包捕获机制包含三个主要部分 1） 包捕获机制 ...

为了查找某个研究领域的相关信息，生物学家往往要花费大量的时间，更糟糕的是，不同的生物学数据库可能会使用不同的术语，好比是一些方言一样，这让信息查找更加麻烦，尤其是使得机器查找无章可循。Gene Ontology就是为了解决这种问题而发起的一个项目。 Gene Ontology中最基本的概念 ...