find_circ的使用教程
find_circ鉴定circRNA的原理 find_circ 的基本原理: find_circ根据Bowtie2比对结果，从没有比对到参考序列的 reads 的两端各提取 20nt 的 anchor 序列，将每一对 anchor 序列再次与参考序列比对。如果 anchor ...
原文：find_circ 识别circRNA 的原理
find circ 通过识别junction reads 来预测circRNA 和参考基因组比对完之后，首先剔除和基因组完全比对的reads,保留没比对上的reads, 这部分reads 直接比是比对不上基因组的，因为其来自不同的外显子区域，直接比对的话不允许这么大片段的缺失，那么如何区分剪切的spliced read 和 来自环状RNA的junction read呢，从上面的示意图我们可以直接 ...
2017-04-20 15:04 0 2407 推荐指数：
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