R语言基因组数据分析可能会用到的data.table函数整理
版权声明：本文为博主原创文章，转载请注明出处 R语言data.table包是自带包data.frame的升级版，用于数据框格式数据的处理，最大的特点快。包括两个方面，一方面是写的快，代码简洁，只要一行命令就可以完成诸多任务，另一方面是处理快，内部处理的步骤进行了程序上 ...
原文：将基因组数据分类并写出文件，python，awk，R data.table速度PK
由于基因组数据过大，想进一步用R语言处理担心系统内存不够，因此想着将文件按染色体拆分，发现python，awk，R 语言都能够非常简单快捷的实现，那么速度是否有差距呢，因此在跑几个 G的大文件之前，先用了 MB的数据对各个脚本进行测试，并且将其速度进行对比。 首先是awk处理，awk进行的是逐行处理，具有自己的语法，具有很大的灵活性，一行代码解决，用时 S， 接下来是用python,python ...
2017-03-26 10:01 0 1354 推荐指数：
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