总是跑数据，却对数据一无所知，这说不过去吧。 看几篇文章吧 Sequencing depth and coverage: key considerations in genomic analyses 只讲二代 Assembly of large genomes using second generation sequencing 参考文献 Identification of optimum seq ...
2016-12-08 10:57 0 11836 推荐指数：
摘要：如果不设置任何过滤标准的话，SOAPsnp会call出更多的SNVs；AtlasSNP2算法比较严格，因此call出来的SNVs数量是最少的，GATK 和 SAMtools call出来的数量位 ...
1.GATK DepthOfCoverage 结果生成四个文件 4096 Jan 13 21:39 ./ 4096 Jan 13 21:05 ../ 6417 Jan 13 21:39 test.sample_cumulative_coverage ...
全基因组测序 全基因组测序分为从头测序(de novo sequencing)和重测序(re-sequencing)。 从头测序(de novo)不需要任何参考基因组信息即可对某个物种的基因组进行测序，利用生物信息学分析方法进行拼接、组装，获得该物种的基因组 ...
单细胞测序技术(single cell sequencing) 2018-03-02 11:02 来源： 一呼百诺 点击次数：6587关键词： 前言 单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向。在这 ...
如何计算每个基因的覆盖度与深度，有多种方法可以完成。如下演示使用samtools depth命令方法 1. 数据下载 1.1 Fastq文件下载 从NCBI下载Illumina Hiseq X Ten平台的RNA-Seq数据SRR7751429信息如上图所示。 1.1.1 ...
SV -- Coverage 覆盖率 本文内容来自： http://www.asic-world.com/systemverilog/coverage.html https://verificationguide.com/systemverilog ...
图像深度是指存储每个像素所用的位数,也用于量度图像的色彩分辨率.图像深度确定彩色图像的每个像素可能有的颜色数,或者确定灰度图像的每个像素可能有的灰度级数.它决定了彩色图像中可出现的最多颜色数,或灰度图像中的最大灰度等级.比如一幅单色图像,若每个象素有8位,则最大灰度数目为2的8次方 ...
强化对深度的理解 在老版本的NGUI中，UI的显示层次关系是依靠z轴进行的。在新版本的NGUI中，所有UI的z轴都被统一，然后用深度来决定和管理显示的层次关系。关于深度，要记住一下关键点： 1.每一个UI Panel和每一个UI控件都一定会有一个Depth，深度值大代表显示的优先级高 ...
