1、下载fastqc wget http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.5.zip 2、解压 unzip fastqc ...
安装 FastQC FastQC 下载 解压 设置权限 加入到 PATH 测试 应该能看到帮助信息,说明已经安装成功 ...
2015-09-24 13:23 0 3309 推荐指数:
1、下载fastqc wget http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.5.zip 2、解压 unzip fastqc ...
1.从官网下载FastQC https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/ 2.解压文件,并进入该文件 将其至于某个文件夹,unzip fastqc_v0.11.5.zip. 3.进入解压目录,设置可执行权限 ...
由于之前的HPC太难用了,所以决定搬家到十楼的工作站,于是就免不了配置必要的工作环境,其中一个少不了要安装的软件是就是fastqc,因为它太常用了。 我先是用conda安装,因为conda实在是太方便了,于是命令行:conda install fastqc 后面一路yes下去搞定,果然很顺 ...
1.fastqc是在Java环境下运行的;所以在安装fastqc之前,Linux下要有相应的Java运行环境(JRE).且java的版本应该在1.8.0版以上 2.java的安装:下载最新版本的Java,注意要下载带有JRE的版本。 3.解压:tar -zxvf java.tar.gz ...
REF https://www.plob.org/article/5987.html 解压后,查看html格式的结果报告。结果分为如下几项: 结果分为绿色的"PASS",黄色的"WARN"和 ...
用FastQC检查二代测序原始数据的质量 2013-01-28 21:28:10| 分类: Bioinformatics | 标签:bioinformatics deep-seq |举报 |字号大中小 订阅 ...
先用conda安装 很顺利 输入 结果 可是输入 这个网上说没有图形界面 可以这样 或者 都可以 ...
FastQC FastQC 是一个基于Java写的测序数据质量评估软件。因为是用跨平台的语言Java写的,自然而然FastQC应是可以在不同系统运行的了。不过也许大多时候我们还是在Linux服务器上用的多吧。 安装 安装软件,方便的还是通过conda了,一行命令: 当然这需要你已经安装 ...