原文:TopHat2 的安装

安装 TopHat 下载最新预编译版本 解压 加入 PATH 即可 测试 应该就看到各种信息,包括版本,基本用法等,这样 tophat 就算安装完成了。 ...

2015-09-24 10:17 0 2142 推荐指数:

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使用bowtie2 tophat2 及 cufflinks 处理RNA-SEQ数据

未经本人授权禁止转载。 1 安装bowtie2 ubuntu上用bin装ok,suse上编译装的,中间包依赖有问题,可用zypper安装所需包 2 安装tophat2 ubuntu上用bin装ok,suse上执行的时候报找不到samtools,但是官网上手册说tophat2不需要 ...

Tue Jan 19 22:36:00 CST 2016 0 2847
tophat的用法

概述:tophat是以bowtie2为核心的一款比对软件。 tophat工作分两步: 1.将reads用bowtie比对到参考基因组上。 2.将unmapped-reads打断成更小的fragments,比对到参考基因组上,如果比对成功,建立剪切点。 用法:tophat ...

Sun Jul 02 06:31:00 CST 2017 0 2278
tophat输出结果junction.bed

tophat输出结果junction.bed BED format BED format provides a flexible way to define the data ...

Thu Oct 03 16:56:00 CST 2013 1 3140
机器学习进阶-图像形态学变化-礼帽与黑帽 1.cv2.TOPHAT(礼帽-原始图片-开运算后图片) 2.cv2.BLACKHAT(黑帽 闭运算-原始图片)

1.op = cv2.TOPHAT 礼帽:原始图片-开运算后的图片 2. op=cv2.BLACKHAT 黑帽: 闭运算后的图片-原始图片 礼帽:表示的是原始图像-开运算(先腐蚀再膨胀)以后的图像 黑帽:表示的是闭运算(先膨胀再腐蚀)后的图像 - 原始图像 代码: 第一步:读取 ...

Mon Feb 18 21:56:00 CST 2019 0 550
 
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