未经本人授权禁止转载。 1 安装bowtie2 ubuntu上用bin装ok,suse上编译装的,中间包依赖有问题,可用zypper安装所需包 2 安装tophat2 ubuntu上用bin装ok,suse上执行的时候报找不到samtools,但是官网上手册说tophat2不需要 ...
安装 TopHat 下载最新预编译版本 解压 加入 PATH 即可 测试 应该就看到各种信息,包括版本,基本用法等,这样 tophat 就算安装完成了。 ...
2015-09-24 10:17 0 2142 推荐指数:
未经本人授权禁止转载。 1 安装bowtie2 ubuntu上用bin装ok,suse上编译装的,中间包依赖有问题,可用zypper安装所需包 2 安装tophat2 ubuntu上用bin装ok,suse上执行的时候报找不到samtools,但是官网上手册说tophat2不需要 ...
概述:tophat是以bowtie2为核心的一款比对软件。 tophat工作分两步: 1.将reads用bowtie比对到参考基因组上。 2.将unmapped-reads打断成更小的fragments,比对到参考基因组上,如果比对成功,建立剪切点。 用法:tophat ...
tophat输出结果junction.bed BED format BED format provides a flexible way to define the data ...
Cole Trapnell said: there are three strategies:1) merge bams and assemble in a single run of Cuffl ...
使用Tophat+cufflinks分析差异表达 2017-06-15 19:09:43 522 0 0 使用TopHat+Cufflinks的流程图 ...
1.op = cv2.TOPHAT 礼帽:原始图片-开运算后的图片 2. op=cv2.BLACKHAT 黑帽: 闭运算后的图片-原始图片 礼帽:表示的是原始图像-开运算(先腐蚀再膨胀)以后的图像 黑帽:表示的是闭运算(先膨胀再腐蚀)后的图像 - 原始图像 代码: 第一步:读取 ...
7. cv2.putText(img, text, loc, text_font, font_scale, color, linestick) # 参数说明:img表示输入图片,text表示需要填写 ...
正常节奏 ...