多重比对序列的格式及其应用 这里对多重序列比对格式(Multiple sequence alignment – MSA)进行总结。在做系统演化分析、序列功能分析、基因预测等,都需要涉及到多重序列比对。特别是当需要用不同软件对多重比对序列进行批量操作时,会遇到各种的格式 ...
实验目的 熟悉构建分子系统发生树的基本过程,获得使用不同建树方法 建树材料和建树参数对建树结果影响的正确认识 掌握使用Clustalx进行序列多重比对的操作方法 掌握使用Phylip软件构建系统发生树的操作方法。 实验原理 在现代分子进化研究中,根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断,将揭示出有关生物进化过程的顺序,有助于我们了解生物进化的历 ...
2013-10-18 21:15 0 4737 推荐指数:
多重比对序列的格式及其应用 这里对多重序列比对格式(Multiple sequence alignment – MSA)进行总结。在做系统演化分析、序列功能分析、基因预测等,都需要涉及到多重序列比对。特别是当需要用不同软件对多重比对序列进行批量操作时,会遇到各种的格式 ...
[转记]MAFFT多重序列比对图解教程 【絮语】 一提到多重序列比对,很多人禁不住就想到ClustalW(Clustalx为ClustalW的GUI版),其实有一款多重序列比对软件-MAFFT,不论从比对速度(Muscle>MAFFT> ...
文章转载于 Original 2017-07-11 liuhui 生信百科 多序列比对(或多序列联配,multiple sequence alignment,MSA),是指把多条(3 条或以上)有系统进化关系的蛋白质或核酸序列进行比对,尽可能地把相同的碱基或氨基酸残基排在同一 ...
Aligning Sequences In this tutorial, we will show how to create a multiple sequence alignm ...
用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大,其下面有非常多的参数,但是一般使用的参数如:-p、-i、-d、-o、-e等几个。 -p: 执行的程序名称 -d: 搜索的数据库名称 -i : 要查询的序列文件名(Query File ...
1.软件的安装: 网站:http://www.megasoftware.net/ windows上安装,下载windows-command line(cc)版本的,格式为zip,解压之后,里面有两 ...
目录 目标物种和序列 相关Seq列表 多序列比对的原理和方法 相关的工具 建树的几种方法 实际操作 Muscle&ClustalW 可视化 ...
2021年了,从零开始几个字可以去掉了,做了很多次服务器搭建,其实能够叫零的之前已经是讲完了。 其实应该做一个总结,但是没有时间,后面再说吧。 本文也没有什么内容,因为很简单: ...