以下是引用Arcgis知乎的：
【解决办法】：
步骤1，删除旧许可。具体方法如下：切换至 arcgis server 账户，导航至【ArcGIS for Server 安装目录】/framework/runtime/.wine/drive_c/Program Files/ESRI/License10.2/sysgen 目录，删除keycodes文件；
步骤2，在终端采取静默授权的方式授权新许可。具体方法如下：切换至 arcgis server 账户，导航至【ArcGIS for Server 安装目录】/tools目录，运行./authorizeSoftware -f XXXXX.ecp 完成授权。关于授权的其他用法，请直接输入./authorizeSoftware -h 以获取更详细的信息。
鄙人自己的记录：
1.将新的许可粘贴到所属arcgis server服务器上：
2.进入安装server服务的目录，进入到tools目录下，然后执行./authorizeSoftware -f /gisapp/authorization_938AFE3F.ecp ：
3.登录Server Manager进行验证：
到此，证明已经更新许可成功了。