首先，貌似迁移DokuWiki其实只要经过以下步骤就可以了：
原文件夹打包 -> 放到新服务器 -> 解压 -> 配置apache，php
其次，遇到的问题，
比如，提示无权访问，提示cache文件夹里面某个文件不可写
打包以及配置apache和php就不说了，下面说可能出现的问题，
(补充个升级PHP的链接，5.4升级成5.6)
1.cache文件夹某个文件不可写(这个比较简单，当出现这个情况的时候，基本就搞定了)
解决方法：直接清空data文件夹里的cache文件夹，注意，cache文件夹要保留
2.浏览器访问地址出现forbiden
3.提示./data/pages/文件夹not found，或不可写
上面两个问题可以归因于一个，selinux的安全机制。
首先说第一个，配置apache的时候，明明端口号打开了，文件权限也给了(比如我直接给777
因为是内网服务，所以在没找到问题的时候，我直接给了777)，但是就是提示forbiden。
然后是第二个，明明目录没问题，比如我的是(/var/www/dokuwiki/data/pages)，
而且也使用chown -R apache.apache /var/www/dokuwiki将文件所有者改成了apache，
同时，使用chmode -R 777 /var/www/dokuwiki，明显赋予了读写权限，
但是依然会提示文件找不到或不可写。
解决方法(适用于内网)：
关掉selinux
具体操作：编辑/etc/selinux/config文件，将SELINUX=enforcing改为SELINUX=disabled。
然后重启Linux。
当然也可以添加安全规则等，具体方法另行查找，毕竟，上面的方法简单粗暴。
另外，关于selinux，可以参考这里。