可以使用AutoHotKey自带的工具。
AutoHotKey安装完成后（我使用的是1.1.0.0），找到安装所在目录下的文件：\Compiler\Ahk2Exe.exe。
程序界面如下：
简单使用：
1、选择源文件（script file)
2、选择目标文件（.exe file）。不选择时，默认在源文件目录下生成同名的exe文件。
3、选择程序图标。不选择时，将是默认的autohotkey图标。
【关键】4、输入密码及验证密码（Passphrase/ Verify passphrase）。这步处理后，可简单地防止程序被反编译出来。