首先，新建Physical Data Model
然后选Database-->Connect-->选择Conection profile配置连接的相关参数。
但是连接的点击测试连接的时候，PowerDesigner控制台会提示Could not Initialize JavaVM!
那应该配置：
PowerDesigner Tools --> General Options --> Variables：
JAR D:\Java\jdk1.6.0_13\bin\jar.exe
JAVA D:\Java\jdk1.6.0_13\bin\java.exe
JAVAC D:\Java\jdk1.6.0_13\bin\javac.exe
JAVADOC D:\Java\jdk1.6.0_13\bin\javadoc.exe
CLASSPATH = E:\Workspaces\my-jar\mysql-connector-java-5.1.7-bin.jar
Path = D:\Java\jdk1.6.0_13\bin;%SystemRoot%\system32;%SystemRoot%;%SystemRoot%\System32\Wbem
其中需要注意的是CLASSPATH如果把.;和java的相关lib配置上的话，会提示找不到驱动。
得修改为 CLASSPATH = E:\Workspaces\my-jar\mysql-connector-java-5.1.7-bin.jar这种形式。