原文:TCGA | CCLE | 數據挖掘基本教程 | GTEx

年 月 日 還好沒有走上純生信的灌水之路,要扎扎實實的搞干濕結合,只有問題問好了 實驗設計好了 數據測好了,生信才能迸發出高能的威力 TCGA數據下載 基本的TPM表達數據 全網最全 TCGA新版數據下載與整理教程來了 來抄作業 單基因泛癌 CCLE數據下載及整理 從GTEX官網下載表達譜數據並與表型文件整理合SummarizedExperiment格式 How do I compare tum ...

2021-12-30 14:14 0 1588 推薦指數:

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GTEx數據庫-TCGA數據挖掘的好幫手

轉自生信菜鳥團,如有侵權j,請聯系微信:biozhangz進行刪除. GTEx數據庫-TCGA數據挖掘的好幫手 Posted on 2018年11月26日 通常我們在挖掘TCGA數據庫的時候,會發現該項目納入的正常組織測序結果是非常少的,也就是說很多病人都不會有他的正常 ...

Sun Apr 12 02:45:00 CST 2020 0 1861
TCGA數據挖掘 | 免疫細胞浸潤分析

問題: 什么是免疫細胞浸潤? 腫瘤組織里都有哪些細胞?有哪些免疫細胞? 免疫細胞浸潤分析的基本原理?相關性 bulk RNA-seq拆分scRNA-seq的原理 免疫浸潤評估常 ...

Tue Feb 08 02:42:00 CST 2022 0 2987
數據挖掘入門系列教程(結束)

從無到有,陸陸續續一個數據挖掘入門系列的教程就寫了18篇博客了,這個是我沒有想到的,本來以為可能寫10篇博客就結束了,但是寫着寫着寫着寫着就寫了這么多: 數據挖掘入門系列教程(一)之親和性分析 數據挖掘入門系列教程(二)之分類問題OneR算法 數據挖掘入門系列教程 ...

Wed May 13 00:38:00 CST 2020 0 585
數據挖掘面試

問題一: 你簡歷中上過的數據挖掘、機器學習等課程,是學校的研究生課程還是自己單獨學習的;回答道:研究生課程有學習,自己單獨私下也有學習 1、監督學習和無監督學習的區別?分類回歸一般屬於哪種?聚類屬於哪種?請舉例你知道的相關有監督學習和無監督學習算法 1:監督學習和無監督學習的區別 ...

Wed Nov 20 17:31:00 CST 2019 0 561
數據挖掘-基本流程

1、定義目標 2、獲取數據 3、數據探索 4、數據預處理(數據清洗-去掉臟數據數據集成-集中、數據變換-規范化、數據規約-精簡) 5、挖掘建模(分類、聚類、關聯、預測) 6、模型評價與發布 ...

Tue Jan 10 03:51:00 CST 2017 0 3835
神奇的數據挖掘

談到BI,就會談到數據挖掘(Data mining)。數據挖掘是指用某些方法和工具,對數據進行分析,發現隱藏規律並利的一種方法。下面我們將通過具體的例子來學習什么是數據挖掘。 案例“上大學分析”-體驗什么是數據挖掘 某社會機構,收集 ...

Thu Oct 10 01:03:00 CST 2013 36 6352
數據挖掘入門

當前工作上需要上對數據進行處理分析,以輔助運營部門工作。在此記錄下一些過程,以總結提高。 准備 由於第一次接觸數據分析以供其他部分同事使用的工作,所以走了一些彎路。一開始的時候是閱讀一些大數據分析的書籍,這些書籍基本都是從工具角度去進行介紹,而沒有從總體的角度去解析這種事情。所以對初期工作 ...

Mon Dec 15 09:23:00 CST 2014 8 1757
數據挖掘模型

挖掘建模根據挖掘目標和數據形式可建立:分類與預測、聚類分析、關聯規則、時序模式、偏差檢測等模型 1.分類與預測 分類與預測是預測問題的兩種主要類型,分類主要是:預測分類標號(離散屬性);預測主要是:建立連續值函數模型,預測給定自變量對應的因變量的值。 1.1 實現過程 (1)分類 ...

Mon Jan 22 07:25:00 CST 2018 1 10001
 
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