原文:答讀者問(1):非模式物種找marker;如何根據marker定義細胞類型

下午花了兩個小時回答讀者的疑問,覺得可以記錄下來,也許能幫到一部分人。 第一位讀者做的是非模式物種的單細胞。 一開始以為是想問我非模式物種的marker基因在哪兒找,讀者朋友也提到了blast 研究的主要細胞類型的marker是有的 讓讀者朋友困惑的是一張表,cluster乘樣本的表,每一個值表示表達這個marker基因的細胞數目。這個表其實沒有多少信息,且容易給人誤導。應該直接從小提琴圖看。 ...

2021-07-23 10:08 0 142 推薦指數:

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大話重構 之 讀者

越來越多人關注《大話重構》系列,一碼感謝大家的支持。從系列開始到現在,有提出疑問的,有說好的,有說壞的,一碼在此一並回答。 :單篇篇幅長,知識點多,看起來很吃力 :如果覺得有難度,不要氣餒,你學習的機會就在眼前。《大話重構》的每篇文章都針對一種代碼壞味道,務求講清“壞”在哪兒,有哪些方法 ...

Tue Jun 09 02:37:00 CST 2015 8 838
細胞分析實錄(9): 展示marker基因的4種圖形(二)

在上一篇中,我已經講解了展示marker基因的前兩種圖形,分別是tsne/umap圖、熱圖,感興趣的讀者可以回顧一下。這一節我們繼續學習堆疊小提琴圖和氣泡圖。 3. 堆疊小提琴圖展示marker基因 相比於其他可視化形式,小提琴圖可以更直觀地展示某一類亞群的某一個基因的表達分布情況 ...

Wed Mar 03 06:25:00 CST 2021 0 946
細胞分析實錄(8): 展示marker基因的4種圖形(一)

今天的內容講講單細胞文章中經常出現的展示細胞marker的圖:tsne/umap圖、熱圖、堆疊小提琴圖、氣泡圖,每個圖我都會用兩種方法繪制。 使用的數據來自文獻:Single-cell transcriptomics reveals regulators underlying immune ...

Sat Jan 09 06:29:00 CST 2021 0 2314
leaflet之自定義marker Icon

leaflet之自定義marker Icon marker圖標可以設置自定義的圖片,以及陰影圖片 准備圖片 創建原始圖標ICON 依據原始圖標創建多個圖標ICON 創建marker設置icon添加到地圖上 點擊查看完整教程 leaflet入門系列教程 ...

Thu Sep 06 17:53:00 CST 2018 0 961
Leaflet中自定義marker的icon圖標

場景 Leaflet中添加標記、折線、圓圈、多邊形、彈窗顯示點擊處坐標: https://blog.csdn.net/BADAO_LIUMANG_QIZHI/article/details/122309679 在上面加載標記使用的是默認圖標,如果要自定義圖標怎么用。 官網有詳細的教程 ...

Wed Jan 05 22:29:00 CST 2022 0 1668
GMap.Net開發之自定義Marker

上一篇文章介紹了如何在WinForm和WPF中使用GMap控件,這篇介紹下GMap中Marker的使用。 自定義Marker,可以理解為在地圖上自定義圖標(Custom Marker),先看看GMap的地圖和圖標的顯示方式: Map控件上可以添加Overlay(圖層),可以添加多個圖層,先 ...

Sun Dec 15 23:33:00 CST 2013 47 22286
SVG.js Marker標記和自定義標簽

一、SVG.Marker 添加標記 SVG.Marker 標記可以被添加到一個線,折線的各點,多邊形和路徑。有三種類型的標記:開始,中間和結束。如果開始表示第一個點,則結束中間的最后一點和中間點。 2.實例 二、SVG.Bare ...

Sun Apr 02 19:31:00 CST 2017 2 3247
 
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