原文:R繪圖(3): 散點圖添加文本注釋

這里以火山圖為例進行說明,在轉錄組分析中,火山圖是很常見的一類圖,縱軸表示p value,橫軸表示log fold change 。單一的散點圖繪制很簡單,火山圖比較難處理的地方就是一些基因的注釋,基因越多,加文本注釋越困難,因為文字會堆在一起,看不清。 示例數據df 是轉錄組做差異表達后的部分結果,df 將logFC絕對值大於 . 的挑出來了。 先看一下,沒加文本的圖 接下來用ggplot 里面 ...

2021-03-08 16:49 0 560 推薦指數:

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R繪圖-散點圖

散點圖是將所有的數據以點的形式展現在直角坐標系上,以顯示變量之間的相互影響程度,點的位置由變量的數值決定,每個點對應一個 X 和 Y 軸點坐標。 散點圖可以使用 plot() 函數來繪制,語法格式如下: plot(x, y, type="p", main, xlab, ylab, xlim ...

Fri Aug 20 03:02:00 CST 2021 0 261
R繪圖(4): 散點圖添加相關系數/回歸方程

屬於比較常用的技巧。下面我用ggplot2內置數據集進行演示: 先來看一下,僅有散點和擬合線的圖 如果想添加擬合的方程,可以使用ggpmisc包的stat_poly_eq()函數,該函數可以擬合多項式方程並生成多種標簽,比如p值、決定系數R方,這些由函數計算出來的量通常名稱 ...

Mon Mar 15 04:13:00 CST 2021 0 715
R繪圖(7): 把散點圖的點換成扇形

前幾天分析了一批單細胞TCR的數據,需要畫這樣一個圖: 行是不同的樣本,列是不同的T細胞類型,每一個位置點的大小表示T細胞的數目多少,並且還需要根據T細胞所屬的克隆型類型塗色。這個圖用來描述TC ...

Fri Jul 23 00:56:00 CST 2021 0 229
R繪圖 第十篇:繪制散點圖(高級)

散點圖用於描述兩個連續性變量間的關系,三個變量之間的關系可以通過3D圖形或氣泡來展示,多個變量之間的兩兩關系可以通過散點圖矩陣來展示。 一,添加了最佳擬合曲線的散點圖 使用基礎函數plot(x,y)來繪制散點圖,其中x和y是數值型向量,代表着圖形中的點(x,y) abline ...

Thu Dec 27 17:01:00 CST 2018 0 9178
R繪圖 第五篇:繪制散點圖(ggplot2)

ggplot2包中繪制點圖的函數有兩個:geom_point和 geom_dotplot,當使用geom_dotplot繪圖時,point的形狀是dot,不能改變點的形狀,因此,geom_dotplot 叫做散點圖(Scatter Plot),通過繪制點來呈現數據的分布,對點分箱的方法有兩種:點 ...

Fri Aug 03 22:52:00 CST 2018 0 20560
R語言添加注釋

使用#,添加注釋 x=c(1,2,3) #zhang ...

Thu Feb 16 01:27:00 CST 2017 0 1598
 
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