原文:【百奧雲GS專欄】全基因組選擇之工具篇

目錄 . 免費開源包 庫 . R包 . Python庫 . 成熟軟件 . WEB GUI工具 前面我們已經介紹了基因組選擇的各類模型,今天主要來了解一下做GS有哪些可用的軟件和工具。基因組選擇處在熱門研究階段,每年都有不少新工具開發出來,可分析的軟件非常之多,為了便於大家更加清晰地了解,這里我將它們分為免費開源包 庫 成熟軟件 WEB GUI工具三類,用戶使用難度依次降低。 . 免費開源包 庫 ...

2021-02-10 15:44 0 480 推薦指數:

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GS專欄】1-基因組選擇介紹

目錄 什么是基因組選擇基因組選擇技術的發展 基因組選擇的原理和流程 基因組選擇的模型 基因組選擇的展望 參考資料 什么是基因組選擇基因組選擇(Genomic Selection,簡稱GS)這一概念由挪威生命科學大學的Theo ...

Wed Dec 30 20:04:00 CST 2020 0 792
GS模型】基因組選擇之rrBLUP

目錄 1. 理論 2. 實操 2.1 rrBLUP包簡介 2.2 實操 3. 補充說明 關於模型 關於交叉驗證 參考資料 1. 理論 rrBLUP是基因組選擇最常用的模型之一,也是間接 ...

Thu Dec 10 01:01:00 CST 2020 0 948
基因組選擇育種(GS)簡介

基因組選擇(Genomic selection, GS)是一種利用覆蓋基因組的高密度標記進行選擇育種的新方法,可通過早期選擇縮短世代間隔,提高育種值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)估計准確性等加快遺傳進展,尤其對低遺傳力、難測定的復雜性狀具有較好 ...

Wed May 13 23:46:00 CST 2020 0 8069
GS文獻】基因組選擇技術在農業動物育種中的應用

中國農業大學等多家單位2017年合作發表在《遺傳》雜志上的綜述,筆記之。 作者中還有李寧院士,不勝唏噓。 1.概述 GS的兩大難題:基因組分型的成本,基因組育種值(genomic estimted breeding value, GEBV)的准確性。 基於個體的基因組估計育種值 ...

Wed Dec 16 01:21:00 CST 2020 0 571
 
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