目錄 1. 前言 2. BLUP方法 ABLUP GBLUP ssGBLUP RRBLUP 3. 貝葉斯方法 ...
目錄 . 免費開源包 庫 . R包 . Python庫 . 成熟軟件 . WEB GUI工具 前面我們已經介紹了基因組選擇的各類模型,今天主要來了解一下做GS有哪些可用的軟件和工具。基因組選擇處在熱門研究階段,每年都有不少新工具開發出來,可分析的軟件非常之多,為了便於大家更加清晰地了解,這里我將它們分為免費開源包 庫 成熟軟件 WEB GUI工具三類,用戶使用難度依次降低。 . 免費開源包 庫 ...
2021-02-10 15:44 0 480 推薦指數:
目錄 1. 前言 2. BLUP方法 ABLUP GBLUP ssGBLUP RRBLUP 3. 貝葉斯方法 ...
目錄 什么是基因組選擇? 基因組選擇技術的發展 基因組選擇的原理和流程 基因組選擇的模型 基因組選擇的展望 參考資料 什么是基因組選擇? 基因組選擇(Genomic Selection,簡稱GS)這一概念由挪威生命科學大學的Theo ...
目錄 1. 理論 2. 實操 2.1 rrBLUP包簡介 2.2 實操 3. 補充說明 關於模型 關於交叉驗證 參考資料 1. 理論 rrBLUP是基因組選擇最常用的模型之一,也是間接 ...
全基因組選擇(Genomic selection, GS)是一種利用覆蓋全基因組的高密度標記進行選擇育種的新方法,可通過早期選擇縮短世代間隔,提高育種值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)估計准確性等加快遺傳進展,尤其對低遺傳力、難測定的復雜性狀具有較好 ...
目錄 1. GS概況 2. GS模型 1)直接法 GBLUP 直接法的模型改進 ①單隨機效應 ②多隨機效應 2)間接 ...
目錄 1. 優勢雜交育種預測 2. GS育種原理與模型算法 嶺回歸和LASSO回歸 貝葉斯方法 GBLUP和RRBLUP 偏最小二乘法 支持向量機/支持向量回歸 其他方法 3. 模型預測能力驗證 ...
目錄 1. 簡介 2. BLUP類模型 3. Bayesian類模型 4. 機器學習 5. GWAS輔助的GS 6. 雜交育種 7. 多性狀 8. 長期選擇 9. 預測准確性評估 10. GS到植物育種 11. 未來展望 ...
中國農業大學等多家單位2017年合作發表在《遺傳》雜志上的綜述,筆記之。 作者中還有李寧院士,不勝唏噓。 1.概述 GS的兩大難題:基因組分型的成本,基因組育種值(genomic estimted breeding value, GEBV)的准確性。 基於個體的基因組估計育種值 ...