目錄 1. 理論 2. 實操 2.1 rrBLUP包簡介 2.2 實操 3. 補充說明 關於模型 關於交叉驗證 參考資料 1. 理論 rrBLUP是基因組選擇最常用的模型之一,也是間接 ...
目錄 簡介 GS示例代碼 簡介 R包sommer內置了C ,運算速度還是比較快的,功能也很豐富,可求解各種復雜模型。語法相比於lme 包也要好懂一些。 建議查看文檔:vignette v .sommer.quick.start 混合線性模型關鍵在於協方差結構的建立,有以下幾類: 復合對稱 Compound Symmetry,CS ,所有方差相等,所有協方差也相等,對應於單變量方法。但是對於不同尺 ...
2020-12-29 16:10 0 484 推薦指數:
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目錄 1. GS概況 2. GS模型 1)直接法 GBLUP 直接法的模型改進 ①單隨機效應 ②多隨機效應 2)間接 ...
目錄 1. 前言 2. BLUP方法 ABLUP GBLUP ssGBLUP RRBLUP 3. 貝葉斯方法 BayesA BayesB BayesC/Cπ/D ...
目錄 1. GS/GP在植物育種中的角色 2. GP模型應用 3. GP模型的准確性 4. 植物育種的GS展望 5. 小結 Genomic SelectioninPlant Breeding: Methods,Models ...
全基因組選擇(Genomic selection, GS)是一種利用覆蓋全基因組的高密度標記進行選擇育種的新方法,可通過早期選擇縮短世代間隔,提高育種值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)估計准確性等加快遺傳進展,尤其對低遺傳力、難測定的復雜性狀具有較好 ...
目錄 說明 1.前言 2.植物GS瓶頸 3.提高GS預測的准確性 4.GS與現代育種技術結合 5.GS開源育種網絡 說明 Enhancing Genetic Gain through Genomic Selection: From ...
目錄 1. 免費開源包/庫 1.1 R包 1.2 Python庫 2. 成熟軟件 3. WEB/GUI工具 前面我們已經介紹了基因組選擇的各類模型,今天主要來了解一下做GS有哪些可用的軟件和工具。基因組選擇處在熱門研究階段 ...
目錄 1. 優勢雜交育種預測 2. GS育種原理與模型算法 嶺回歸和LASSO回歸 貝葉斯方法 GBLUP和RRBLUP 偏最小二乘法 支持向量機/支持向量回歸 其他方法 3. 模型預測能力驗證 ...