原文:【GS模型】使用R包sommer進行基因組選擇的GBLUP和RRBLUP分析?

目錄 簡介 GS示例代碼 簡介 R包sommer內置了C ,運算速度還是比較快的,功能也很豐富,可求解各種復雜模型。語法相比於lme 包也要好懂一些。 建議查看文檔:vignette v .sommer.quick.start 混合線性模型關鍵在於協方差結構的建立,有以下幾類: 復合對稱 Compound Symmetry,CS ,所有方差相等,所有協方差也相等,對應於單變量方法。但是對於不同尺 ...

2020-12-29 16:10 0 484 推薦指數:

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GS模型】全基因組選擇rrBLUP

目錄 1. 理論 2. 實操 2.1 rrBLUP簡介 2.2 實操 3. 補充說明 關於模型 關於交叉驗證 參考資料 1. 理論 rrBLUP基因組選擇最常用的模型之一,也是間接 ...

Thu Dec 10 01:01:00 CST 2020 0 948
基因組選擇育種(GS)簡介

基因組選擇(Genomic selection, GS)是一種利用覆蓋全基因組的高密度標記進行選擇育種的新方法,可通過早期選擇縮短世代間隔,提高育種值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)估計准確性等加快遺傳進展,尤其對低遺傳力、難測定的復雜性狀具有較好 ...

Wed May 13 23:46:00 CST 2020 0 8069
【百奧雲GS專欄】全基因組選擇之工具篇

目錄 1. 免費開源/庫 1.1 R 1.2 Python庫 2. 成熟軟件 3. WEB/GUI工具 前面我們已經介紹了基因組選擇的各類模型,今天主要來了解一下做GS有哪些可用的軟件和工具。基因組選擇處在熱門研究階段 ...

Wed Feb 10 23:44:00 CST 2021 0 480
 
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