利用plink軟件基於LD信息過濾SNP
最近有需求，對WGS測序獲得SNP信息進行篩減，可問題是測序個體少，call rate，maf，hwe，等條件過濾后，snp數量還是千萬級別，所以后面利用plink工具根據LD信息來濾除大量SNP標記。 工具版本：PLINK v1.90b4.6 64-bit (15 Aug 2017) 一、格式 ...
原文：plink 軟件中 --recode 01、--recode 12、--output-missing-genotype的作用
准備測試數據， 個樣本， 個位點 recode recode recode output missing genotype 結論： recode :將次等位基因變為 ，主等位基因變為 recode ：需結合 output missing genotype使用，將次等位基因變為 ，主等位基因變為 ， output missing genotype作用是設定缺失基因型的代表字符。 ...
2020-10-10 20:58 0 649 推薦指數：
相關推薦
Idea01 Idea2018中集成Tomcat9導致OutPut亂碼
版本和平台 idea2018.3 tomcat9 jdk1.8 windows7 64位 output亂碼 經過測試，項目編碼格式設置為utf-8，在main方法中輸出中文正常。 而iedea集成tomcat后，output輸出啟動日志信息亂碼，經過判斷，該亂碼源於 ...
httprunner 2.x學習12-在testcase中傳遞變量(output)
前言 httprunner 2.x 的版本，testcase 可以引用 api, 同樣的 testcase 也可以引用另外一個 testcase 文件 在2個 testcase 中傳遞變量可以用到 output 關鍵字 testcase 導入 api 測試用例（testcase) 是測試步驟 ...
plink軟件計算位點雜合度和樣本雜合度
雜合度計算分為兩種：位點雜合度和樣本雜合度 1、計算位點雜合度，測試數據如下: 2、--hardy計算位點雜合度 2、--het 計算樣本雜合度 ...
PCA 主成分分析實踐 plink軟件
。 2、運行plink軟件，命令如下： plink --file test --sheep --pca 5 h ...
瀏覽器F12，Network中各按鈕的作用
Network下 preserve log:勾選，頁面發生跳轉，接口不丟失；（比如登錄成功跳轉到首頁，登錄的接口就沒了,勾選Perserve log，會記錄跳轉前的接口）； Disable ...
sql中out與output
, --numB為另一參數 @numReturn int output --此為Out ...
01-12 56—60
56、從0-99這100個數中隨機取出10個，要求不能重復，可以自己設計數據結構 57、介紹一下try except的用法和作用? 58、在python中如何拋出，捕獲，處理異常？ 59、enumerate 的作用是什么? 60、lambda 表達式格式以及應用場景? ...