目前有很多的數據庫都存儲了蛋白序列,比如NCBI Refseq, protein, swissprot 等,在各個數據庫之間,或者是在某個數據庫中,蛋白序列有大量冗余;為了方便使用,ncbi 構建了nr 庫, 全稱是 RefSeq non-redundant proteins ...
目錄 .准備本地數據庫文件 . NR庫下載 . Taxonomy數據庫下載 .按物種拆分NR庫 . 第一步:獲得Aceesson和分類物種的對應關系 . 第二步:獲得分類物種的序列 . 第三步:建庫和比對 .准備本地數據庫文件 NR Non Redundant Protein Sequence Database 非冗余蛋白庫,是所有GenBank EMBL DDBJ PDB中的非冗余蛋白序列。T ...
2020-09-26 20:27 0 1112 推薦指數:
目前有很多的數據庫都存儲了蛋白序列,比如NCBI Refseq, protein, swissprot 等,在各個數據庫之間,或者是在某個數據庫中,蛋白序列有大量冗余;為了方便使用,ncbi 構建了nr 庫, 全稱是 RefSeq non-redundant proteins ...
數據庫的水平拆分 比如說訂單,你第一要考慮業務場景,查詢訂單是哪些用戶:其一是前端的用戶;其二是后端的用戶商家和客服。第二,它的存儲量,訂單的數據量是非常大的。但對商品和庫存來說,它是有一定的范圍的,不會無限的大,因為一個網站或者一個商店,你賣的SKU數量是 有限的。一個大超市可能是幾萬個SKU ...
將存放在同一個數據庫中的數據分散存放到多個數據庫上,實現分布存儲,通過路由規則路由訪問特定的數據庫這樣一來每次訪問面對的就不是單台服務器了,而是N台服務器,這樣就可以降低單台機器的負載壓力。sqlserver 2005版本之后,可以友好的支持“表分區”。 垂直(縱向)拆分:是指 ...
杭州湖畔網絡技術有限公司是一家專業提供SaaS化電商ERP服務的創業公司,主要用戶群體為經營淘寶、天貓、京東等主流電商平台、自建商城、線下渠道的商家及中小企業。作為SaaS服務提供商,服務數萬乃至數十萬級用戶是業務架構初期就必須考慮的問題。龐大的用戶群以及海量的用戶數據意味着基礎設施的構建必須兼顧 ...
當我們使用讀寫分離、緩存后,數據庫的壓力還是很大的時候,這就需要使用到數據庫拆分了。 數據庫拆分簡單來說,就是指通過某種特定的條件,按照某個維度,將我們存放在同一個數據庫中的數據 ...
當我們使用讀寫分離、緩存后,數據庫的壓力還是很大的時候,這就需要使用到數據庫拆分了。 數據庫拆分簡單來說,就是指通過某種特定的條件,按照某個維度,將我們存放在同一個數據庫中的數據分散存放到多個數據庫(主機)上面以達到分散單庫(主機)負載 ...
隨着業務的發展,數據庫成為了整個系統性能的一個瓶頸,這時候就需要對數據庫進行優化,但是單單是優化只能提高有限的一點性能,這時候要想解決問題需要的是從數據庫架構層面去思考問題。數據庫的架構是一個很大的課題,里面最實用的有兩個,一個是數據庫拆分,一個是讀寫分離。今天就來談談數據庫的兩種拆分方式 ...
目錄 KEGG本地庫文件 按物種拆分KEGG數據庫 1.獲得物種分類信息 2.獲得物種分類的序列信息並建庫 3.獲得物種分類的K-ko對應文件 根據相似性原理,序列相似,功能相似,所有功能注釋無非是用比對工具將輸入序列比對 ...