原文:omop cdm數據質控

omop cdm數據質控 安裝R與package 安裝R環境 使用如下命令安裝並啟用 EPEL 如果已經安裝過則忽略 使用如下命令安裝R 安裝DatabaseConnector包 OHDSI開源項目,R包,提供連接數據庫方法,可連接各種數據庫,直接從鏡像安裝 github地址https: github.com OHDSI DatabaseConnector 安裝DataQualityDashboa ...

2020-09-21 18:48 0 522 推薦指數:

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測序數據質控-FastQC

通常我們下機得到的數據是raw reads,但是公司通常會質控一份給我們,所以到很多人手上就是clean data了。我們再次使用fastqc來進行測序數據質量查看以及結果分析。 fastqc的操作: 1. FastQC使用 fastqc -f [bam | sam | fastq ...

Thu Jan 10 21:14:00 CST 2019 0 2076
mimic-omop專病數據生產ETL

MIMIC-OMOP轉換 1.數據與環境准備 1.1 MIMIC-III v1.4數據集獲取 需從mimic官網注冊申請並下載數據 1.2 mimic-omop開源項目源碼下載 https://github.com/MIT-LCP/mimic-omop 1.3 ...

Fri Sep 04 20:16:00 CST 2020 1 548
GATK--數據預處理,質控,檢測變異

版權聲明:本文源自 解螺旋的礦工, 由 XP 整理發表,共 13781 字。 轉載請注明:從零開始完整學習全基因組測序(WGS)數據分析:第4節 構建WGS主流程 | Public Library of Bioinformatics 轉載地址:https://www.plob.org ...

Tue Oct 16 23:49:00 CST 2018 0 4124
概念數據模型CDM基礎

概念數據模型CDM 概念數據模型是設計數據庫不可或缺的一步,是整個數據庫設計的關鍵,CDM的主要作用如下: 1)能夠真實地模擬真實世界,是需求分析人員和數據庫設計人員溝通的橋梁。2)將系統需求分析得到的用戶需求抽象為信息結構過程。3)是后續邏輯數據模型和物理數據模型的基礎 ...

Fri May 19 18:06:00 CST 2017 0 1269
數據倉庫模型之CDM、LDM與PDM的區別

數據倉庫建設中,概念數據模型設計與邏輯數據模型設計、物理數據模型設計是數據庫及數據倉庫模型設計的三個主要步驟。 conceptual data model 概念數據模型是最終用戶對數據存儲的看法,反映了最終用戶綜合性的信息需求,它以數據類的方式描述企業級的數據需求,數據類代表了在業務環境中 ...

Thu Nov 19 00:37:00 CST 2020 0 1153
PowerDesigner數據模型(CDM—PDM—SQL腳本的轉換流程)

原文地址: PowerDesigner數據模型(CDM—PDM—SQL腳本的轉換流程) 作者: zzenglish 有圖片的參考http://blog.sina.com.cn/s/blog_647426750100o8gi.html 需要去掉oracle表名的雙引號的方法 ...

Thu Dec 11 18:26:00 CST 2014 0 5917
 
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