我的原始測序數據是雙端測序，在用trim_galore軟件去接頭的這一步，使用的命令行是 相當然的以為軟件會默認為雙端測序，結果接下來一步用tophat軟件mapping到參考基因組上的時候，發現mapping率只用10%，低的驚人。后來排除建庫失敗的可能，我去查看 ...

Trimmomatic 注意：軟件工具一般會定期進行迭代更新，如果使用出現問題，請查看官方文檔。 可以用來切除illumina測序平台的接頭序列，還可以去除由我們自己指定的特定接頭序列，而且同時也能夠過濾read末尾的低質量序列。具體的原理就是通過滑動一定長度的窗口，計算 ...

fastp 注意：軟件工具一般會定期進行迭代更新，如果使用出現問題，請查看官方文檔。 fastp是一款數據質控過濾軟件，作者是陳實富，來自深圳海普洛斯公司。他們將這款工具開源免費使用，這一點是非常值得稱贊的。其實國內很多測序公司都有自己開發的數據處理程序，不過很多都在內部使用 ...

Trim Galore是對FastQC和cutadapt的包裝。適用於所有高通量測序，包括RRBS(Reduced Representation Bisulfite-Seq )、 Illumina、Nextera和smallRNA測序平台的雙端和單端數據。主要功能包括兩步：第一步首先去除低質量鹼基 ...

ipmi 檢視 What links here 週二, 07/31/2007 - 10:12 — sunchiahome ...

Trim Galore是一個非常流行的用於「去接頭序列」的軟件，用於處理高通量測序得到的原始數據。通常我們從測序公司拿到數據后，第一步就是評估數據的質量以及對raw data去接頭處理。公司拿來的數據通常附帶了clean data以及去接頭的說明文件，我自己重新實現了一下trim的過程。參數都是 ...

前言 關於蛋白質組學，你是不是已經聽了太多公司的宣講，介紹了一大堆的技術名詞，反而越聽越懵懂，腦袋一團亂麻？就和傳話游戲一樣，當我們接收了多手信息以后，得到的信息就越不准確。那么，何不自己看一看第一 ...

Ipinstall軟件工具操作說明 安居寶Ipinstall軟件工具是用於聯網型對講系統中網絡設備的屬性及參數修改，該設備在系統中是否能正常運行，其屬性和參數的設置起着決定性的作用， 然而設備的屬性、參數設置是否能成功地設置好，則關系着Ipinstall軟件工具的正確操作與否。 文件 ...