DNA甲基化
一、DNA甲基化簡介 1 、概念：DNA甲基化是一種重要的表觀遺傳，是指DNA被化學小分子修飾的一種方式，即甲基（-CH3）共價結合到脫氧核糖核苷酸上，可以不改變脫氧核糖核苷酸序列而引起基因表達的的改變。 2 、發生位點：真核生物常見的甲基化位點有CpG（最主要）、CHG（H指A/T/C ...
原文：甲基化數據QC：使用甲基化數據計算樣本間的相關性
樣本間的相關性，可以反映公司加樣時是否存在重復加樣的錯誤。 下面簡要介紹一下如果利用甲基化數據計算樣本間的相關性 提取甲基化探針的snp位點 CpG的beta值 下面用的示例文件是minfi包自帶的。 如果是自己的數據，那么提取甲基化snp位點用的是沒有經過過濾的原始數據。 首先，安裝： 這里可以看到不同探針的情況： 一條龍服務，提取甲基化探針的snp位點 CpG的beta值： CpG和SNP的b ...
2020-05-26 19:27 2 572 推薦指數：
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