原文:FDR及Benjamini-Hochberg方法

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2020-02-28 18:54 0 961 推薦指數:

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FDR校正

一、假設檢驗 假設檢驗的基本思路是: 設立零假設(null hypothesis)H0,以及與零假設H0相對應的非零假設(alternative hypothesis)H1,在假設H0成立的前提下 ...

Mon Aug 03 05:06:00 CST 2020 0 699
matlab FDR校正

http://home.52brain.com/forum.php?mod=viewthread&tid=27066&page=1#pid170857 http://www.math ...

Sat Nov 28 17:46:00 CST 2015 0 4747
SPM FDR校正

來源: http://blog.sciencenet.cn/blog-479412-572049.html,http://52brain.com/thread-15512-1-1.html SPM8允許兩種FDR校驗。一個是voxel-wise FDR,另一個是topological ...

Wed Oct 28 23:41:00 CST 2015 0 3154
差異表達分析之FDR

差異表達分析之FDR 隨着測序成本的不斷降低,轉錄組測序分析已逐漸成為一種很常用的分析手段。但對於轉錄組分析當中的一些概念,很多人還不是很清楚。今天,小編就來談談在轉錄組分析中,經常會遇到的一個概念FDR,那什么是FDR?為什么要用FDR呢?一起來學習吧! 什么是FDR ...

Wed Nov 07 06:42:00 CST 2018 0 1757
p值還是 FDR ?

p值還是 FDR ? 差異分析 如何篩選顯著性差異基因,p value, FDR 如何選 經常有同學詢問如何篩選差異的基因(蛋白)。已經計算了表達量和p value值,差異的基因(蛋白)太多了,如何篩選。其中最為關鍵的是需要對p value進行校正 ...

Sat Nov 10 05:40:00 CST 2018 0 1386
淺談多重檢驗校正FDR

淺談多重檢驗校正FDR Posted: 四月 12, 2017 Under: Basic By Kai no Comments 例如,在我們對鑒定到的差異蛋白做GO功能注釋后,通常會計算一個p值。當某個蛋白的p值小於0.05(5%)時,我們通常認為這個蛋白在兩個樣本中的表達 ...

Sat Nov 10 05:37:00 CST 2018 0 2238
Multiple Testing | 多重假設檢驗 | FDR

RNA-seq數據分析中,為了鑒定兩個group 差異表達的基因,會針對每一個基因分別做假設檢驗(例如T-test),這里會出來一個P-value,但是往往R中專門做差異表達的package,還會有Adjusted-P 這么一個P-value。或者我們經常會碰到FDR這個概念。這些說的都是 ...

Sun Jul 26 01:59:00 CST 2020 0 1453
 
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