原文:txt文件轉為fasta文件

inf media disk CJX Genechi chi sum test.txt outf media disk CJX Genechi chi sum test .txt def readwrite inf,outf : f open inf, r out open outf, w next f 不要第一行 for line in f.readlines : list line line. ...

2019-10-10 22:11 0 919 推薦指數:

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fasta文件拆分與合並

Linux中fasta文件的拆分與合並 FASTA文件的拆分: (1)如果從一個文件a提取第11至20個序列存到另一個文件b: awk -v RS='>' 'NR>1{i++}i>=10&&i<=21{print "> ...

Wed Mar 23 20:29:00 CST 2016 0 3529
FASTA文件分割

FASTA格式是一種用於記錄序列的文本格式,在生信分析中經常會用到.fasta文件中往往儲存成千上萬條序列,而在某些時候,需要對文件進行分割,如分割成每個序列一個文件,或分割成較小的fasta文件 假如有如下數據: Tricas1.fasta $ head Tricas1.fasta ...

Fri Feb 22 23:29:00 CST 2019 0 1208
excel轉為txt文件 簡單代碼

package cn.com.mcd.util; import java.io.File;import java.io.FileInputStream;import java.io.FileOutp ...

Mon Mar 20 23:45:00 CST 2017 0 1356
MATLAB中將mat文件轉為txt格式文件

直接保存為txt文件: 可以用fprintf函數,來代替save函數 比如現在我有一個變量a=[0.1223 345.4544] 如果我想保存它的話,可以用下面的程序: fid = fopen('a.txt','wt'); fprintf(fid,'%6.4f %8.4f\n ...

Tue Apr 24 18:47:00 CST 2018 0 5187
fasta文件中序列的排序

同樣的名為read_1.fa 的fasta文件,里面有若干序列,如: > ...

Thu May 18 06:03:00 CST 2017 0 1322
Linux文件排序和FASTA文件操作

文件排序 seq: 產生一系列的數字; man seq查看其具體使用。我們這使用seq產生下游分析所用到的輸入文件。 # 產生從1到10的數,步長為1 $ seq 1 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 # 產生從1到10的數,步長為1,用空格分割 ...

Sun Aug 27 05:38:00 CST 2017 0 1513
 
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