原文:TCGA各種腫瘤數據的20多種不同玩法/挖掘方法

腫瘤基因組圖譜 The Cancer Genome Atlas,TCGA 計划是由美國國家癌症研究院 National Cancer Institute,NCI 和美國國家人類基因組研究所 National Human Genome Research Institute,NHGRI 於 年聯合啟動的項目,目前共計研究 種癌症類型。 TCGA利用大規模測序為主的基因組分析技術,從基因組 表觀遺傳組 ...

2019-09-21 20:23 0 4986 推薦指數:

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TCGA | CCLE | 數據挖掘基本教程 | GTEx

2023年05月02日 還好沒有走上純生信的灌水之路,要扎扎實實的搞干濕結合,只有問題問好了、實驗設計好了、數據測好了,生信才能迸發出高能的威力! TCGA數據下載 基本的TPM表達數據 全網最全!TCGA新版數據下載與整理教程來了!來抄作業! 單基因泛癌|CCLE數據下載 ...

Thu Dec 30 22:14:00 CST 2021 0 1588
腫瘤分析數據挖掘及信息解讀

目錄 腫瘤基礎 腫瘤基因組基礎 腫瘤高級分析模塊 1. SNV和InDel 1. 1體細胞SNV和InDel 1)超突變樣本分類 2)SMGs 3)突變特征 ...

Thu Jul 02 07:09:00 CST 2020 0 2092
微服務化不同階段 Kubernetes 的不同玩法

本文由 網易雲 發布。 作為容器集群管理技術競爭的大贏家,Kubernetes 已經和微服務緊密聯系,采用 Kubernetes 的企業往往都開始了微服務架構的探索。然而不同企業不同階段的微 ...

Tue Apr 17 01:11:00 CST 2018 0 1171
TCGA數據挖掘 | 免疫細胞浸潤分析

問題: 什么是免疫細胞浸潤? 腫瘤組織里都有哪些細胞?有哪些免疫細胞? 免疫細胞浸潤分析的基本原理?相關性 bulk RNA-seq拆分scRNA-seq的原理 免疫浸潤評估常用的工具 什么是免疫浸潤細胞? 腫瘤浸潤淋巴細胞(英語 ...

Tue Feb 08 02:42:00 CST 2022 0 2987
GTEx數據庫-TCGA數據挖掘的好幫手

轉自生信菜鳥團,如有侵權j,請聯系微信:biozhangz進行刪除. GTEx數據庫-TCGA數據挖掘的好幫手 Posted on 2018年11月26日 通常我們在挖掘TCGA數據庫的時候,會發現該項目納入的正常組織測序結果是非常少的,也就是說很多病人都不會有他的正常 ...

Sun Apr 12 02:45:00 CST 2020 0 1861
跟我一起數據挖掘20)——網站日志挖掘

收集web日志的目的 Web日志挖掘是指采用數據挖掘技術,對站點用戶訪問Web服務器過程中產生的日志數據進行分析處理,從而發現Web用戶的訪問模式和興趣愛好等,這些信息對站點建設潛在有用的可理解的未知信息和知識,用於分析站點的被訪問情況,輔助站點管理和決策支持等。 1、以改進web站點設計 ...

Thu Mar 05 23:57:00 CST 2015 0 7866
js中switch的多種玩法

前言 秉承着萬物皆可盤的想法,今天來玩一玩 js 的中 switch 語法。 - 普通用法: switch的普通玩法,就不寫太多,屬於基礎知識 ...

Fri Apr 30 20:30:00 CST 2021 0 219
 
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