WGCNA:(加權共表達網絡分析) 步驟 1.構建基因共表達網絡,基因是如何變化的,在某個表型變化時,一群基因上調,一群基因下調。這一群基因就是共表達的,形成一個網絡。 2.給共表達的網絡分配不同的模塊。 3.將模塊與性狀結合。 4.研究模塊的關系。 5.diver ...
這篇文章更多的是對於混亂的中文資源的梳理,並補充了一些沒有提到的重要參數,希望大家不會踩坑。 . 簡介 . 背景 WGCNA weighted gene co expression network analysis,權重基因共表達網絡分析 是一種分析多個樣本基因表達模式的分析方法,可將表達模式相似的基因進行聚類,並分析模塊與特定性狀或表型之間的關聯關系,因此在基因組研究中被廣泛應用。 相比於只關 ...
2019-07-02 16:36 0 4470 推薦指數:
WGCNA:(加權共表達網絡分析) 步驟 1.構建基因共表達網絡,基因是如何變化的,在某個表型變化時,一群基因上調,一群基因下調。這一群基因就是共表達的,形成一個網絡。 2.給共表達的網絡分配不同的模塊。 3.將模塊與性狀結合。 4.研究模塊的關系。 5.diver ...
https://www.sohu.com/a/230486907_278730 ...
做RNA-seq的數據分析,一直弄不清楚實驗過程,最近有時間就找一些資料來了解一下,同時將整理的資料記錄下來,方便以后查找。 來源資料:【3D演示】基因的表達(原版+字幕版) 人體從食物中獲取營養的過程也就是化學消化過程,是通過酶對食物進行分解來得到營養物質。DNA用來制造酶和各種蛋白質。DNA ...
基因調控網絡的概念在之前已經簡要介紹過:https://www.cnblogs.com/pear-linzhu/p/12313951.html 沃丁頓表觀遺傳景觀(The Waddington's epigenetic landscape) 是描述基因調控下細胞分化的動態性的一個經典的隱喻 ...
EL 全名為Expression Language EL 語法很簡單,它最大的特點就是使用上很方便。接下來介紹EL主要的語法結構: ${sessionScope.user.sex} 所有EL都是 ...
基因表達式編程(Gene Expression Programming,GEP)是由葡萄牙科學家Candida Ferreira 2001年提出來的一種新型遺傳算法,其特點是將基因型和表現型分離。GEP 繼承了GA的快速、易用和GP的易變、多能,比GA,GP提高速度100 - 1000000倍 ...
理解不了,那,那就算了叭,畢竟后面視頻還是會講的,逃不過的……但是WGCNA分析大概一個什么流程是的知道的。 加權基因 ...
Jenkins是一個開源軟件項目,旨在提供一個開放易用的軟件平台,使軟件的持續集成變成可能。Jenkins是基於Java開發的一種持續集成工具,用於監控持續重復的工作,功能包括:1、持續的軟件版本 ...