Linux中fasta文件的拆分與合並 FASTA文件的拆分: (1)如果從一個文件a提取第11至20個序列存到另一個文件b: awk -v RS='>' 'NR>1{i++}i>=10&&i<=21{print "> ...
合並並轉化一代測序seq純文本為fasta格式文件 合並文件夾下的純文本文件 批量序列拼接 use strict use warnings open T, lt T a.fas open R, lt R a.fas open H, gt Haplotypes.fas my t lt T gt my r lt R gt sub combine print H gt n my tag foreach ...
2018-11-13 11:01 0 788 推薦指數:
Linux中fasta文件的拆分與合並 FASTA文件的拆分: (1)如果從一個文件a提取第11至20個序列存到另一個文件b: awk -v RS='>' 'NR>1{i++}i>=10&&i<=21{print "> ...
split :可以將一個大文件分割成多個小文件,有時候需要將問卷分割成更小的片段,比如提高可讀性,生成日志。 語法: split [OPTION]... [INPUT [PREFIX]] Output fixed-size pieces of INPUT to PREFIXaa ...
前言 ofd文件拆分合並會在多個場合用到,但市面上此類工具並不多。拆分和合並雖然為兩個功能,但從編程角度考慮,其處理思路有相同之處。文章就以合並為例,講一下處理思路。作者也寫了一個拆分合並小工具(加入qq群618168615下載),歡迎使用。 程序界面如下: 具有的功能:ofd合並 ...
一、Split 和 Select (使用split切分過的流是不能被二次切分的) DataStream --> SplitStream : 根據特征把一個DataSteam 拆分成兩個或者多個DataStream. SplitStream --> ...
代碼演示 橫向合並: 運行結果: 代碼演示 縱向合並: 原文:https://blog.csdn.net/qq_35415600/article/details/70237433 ...
-- 1.splitByChar(separator, s) 將字符串以‘separator’拆分成多個子串。 -- 2.splitByString(separator, s) -- 3.alphaTokens(s) 從范圍a-z和A-Z中選擇連續字節 ...
使用Perl合並文件 有時需要將整個目錄下的小文件合並到一個文件中,以便查閱檢索 特性 整個目錄完全遍歷,自動存入單個文件 順序遍歷文件 待合並的目錄 合並后的文件內容 Perl代碼 ...
一、關於程序: FUN:計算FASTA文件中每條序列中G和C的含量百分比,輸出最大值及其id INPUT:FASTA格式文件 >seq1 CGCCGAGCGCTTGACCTCCAGCAAGACGCCGTCTGGCACATGCAACGAGCTGTAGCAGAC >seq2 ...